More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1999 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1999  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 
327 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal  0.0256185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3215  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  66.24 
 
 
324 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0996  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  63.09 
 
 
338 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100397  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2556  serine/threonine dehydratase  64.22 
 
 
324 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2024  serine/threonine dehydratase  60.7 
 
 
327 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2250  serine/threonine dehydratase  63.26 
 
 
324 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2154  serine/threonine dehydratase  60.7 
 
 
327 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3108  serine/threonine dehydratase  60.7 
 
 
327 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1524  serine/threonine dehydratase  61.66 
 
 
327 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00616628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0755  serine/threonine dehydratase  60.7 
 
 
327 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284278  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3078  serine/threonine dehydratase  60.7 
 
 
327 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3024  serine/threonine dehydratase  61.02 
 
 
327 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2589  serine/threonine dehydratase  60.7 
 
 
327 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1807  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  64.52 
 
 
322 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3470  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  63.69 
 
 
318 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1493  serine/threonine dehydratase  61.27 
 
 
324 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4343  serine/threonine dehydratase  58.82 
 
 
324 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3882  serine/threonine dehydratase  58.82 
 
 
324 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0375891 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5857  serine/threonine dehydratase  60 
 
 
324 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3217  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  61.06 
 
 
324 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555071  normal  0.861719 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4000  serine/threonine dehydratase  61.74 
 
 
325 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4113  serine/threonine dehydratase  61.74 
 
 
325 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.559381  normal  0.528842 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0534  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  61.32 
 
 
321 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5756  serine/threonine dehydratase  60.12 
 
 
320 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000717119  hitchhiker  0.000000000000616455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3918  serine/threonine dehydratase  60 
 
 
324 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4450  serine/threonine dehydratase  60 
 
 
324 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0152  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  62.97 
 
 
318 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4825  serine/threonine dehydratase  58.6 
 
 
322 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00349984  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4177  serine/threonine dehydratase  60.8 
 
 
326 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04793  serine/threonine dehydratase  63.52 
 
 
323 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.0296686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3519  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  58.75 
 
 
339 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00283546  normal  0.133146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1698  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  58.82 
 
 
328 aa  363  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4347  serine/threonine dehydratase  61.78 
 
 
322 aa  364  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  52.65 
 
 
329 aa  362  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4565  serine/threonine dehydratase  58.39 
 
 
320 aa  362  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.026373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29410  serine/threonine dehydratase  60.47 
 
 
320 aa  359  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1894  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  58.84 
 
 
324 aa  358  9e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.19276 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3783  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  58.47 
 
 
323 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.930239  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0886  serine/threonine dehydratase  62.1 
 
 
321 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3108  serine/threonine dehydratase  61.78 
 
 
321 aa  348  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611552  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4607  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  61.39 
 
 
318 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2122  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  55.35 
 
 
332 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113848  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0305  serine/threonine dehydratase  54.14 
 
 
322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  52.29 
 
 
320 aa  329  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.29 
 
 
321 aa  315  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2376  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.45 
 
 
317 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1722  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.84 
 
 
320 aa  261  1e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0656  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.14 
 
 
325 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360995  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3309  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.38 
 
 
319 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0279719  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4366  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.5 
 
 
315 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1447  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.41 
 
 
330 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0170532  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1010  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  44.07 
 
 
315 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.929985 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4110  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.53 
 
 
333 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0888  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.13 
 
 
324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1623  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.24 
 
 
328 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  45.25 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4888  putative threonine dehydratase, catabolic  38.94 
 
 
325 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.54 
 
 
332 aa  243  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1632  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.77 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.451091  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  40.51 
 
 
403 aa  242  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4489  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.12 
 
 
331 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0980  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.7 
 
 
326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3920  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.81 
 
 
315 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903955  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1389  putative threonine dehydratase  38.02 
 
 
326 aa  236  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2700  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.16 
 
 
321 aa  236  4e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  38.28 
 
 
403 aa  235  6e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  40.65 
 
 
405 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.13 
 
 
319 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5562  L-threonine ammonia-lyase  41.91 
 
 
329 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3581  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.39 
 
 
319 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.961282  normal  0.253572 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2603  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.85 
 
 
320 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000516286  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9151  threonine dehydratase  43.12 
 
 
322 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272259  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1148  putative serine/threonine dehydratase  45.02 
 
 
320 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.697315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1506  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.63 
 
 
340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88993  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  39.31 
 
 
402 aa  225  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3282  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.45 
 
 
324 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  39.93 
 
 
403 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.72 
 
 
304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  42.12 
 
 
358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  39.74 
 
 
415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  39.33 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1902  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.71 
 
 
327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0309  L-threonine ammonia-lyase  43.79 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  37.59 
 
 
402 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  40.54 
 
 
395 aa  219  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  41.69 
 
 
402 aa  217  2e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.92 
 
 
315 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  40.96 
 
 
403 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  38.98 
 
 
403 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  37.62 
 
 
403 aa  212  5.999999999999999e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  35.09 
 
 
404 aa  212  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  41.87 
 
 
406 aa  212  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  42.81 
 
 
404 aa  212  9e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0926  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.61 
 
 
325 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  40.84 
 
 
402 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.02 
 
 
325 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0781846  normal  0.0456931 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  35.1 
 
 
403 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  42.86 
 
 
402 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2252  L-threonine ammonia-lyase  43.28 
 
 
325 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  38.66 
 
 
403 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>