More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4110 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4110  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 333 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1447  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  62.66 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0170532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4489  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  64.16 
 
 		 331 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5562  L-threonine ammonia-lyase  61.72 
 
 		 329 aa  364  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1632  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  63.64 
 
 		 328 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.451091  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1623  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  63.64 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0656  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  58.12 
 
 		 325 aa  338  8e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360995  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1506  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.99 
 
 		 340 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2488  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  58.75 
 
 		 327 aa  298  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0974826  normal  0.0534414 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1589  L-threonine ammonia-lyase  48.93 
 
 		 329 aa  296  3e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00276702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9151  threonine dehydratase  51.58 
 
 		 322 aa  295  6e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.272259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3581  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.53 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.961282  normal  0.253572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0309  L-threonine ammonia-lyase  53 
 
 		 324 aa  286  5e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  53.14 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0781846  normal  0.0456931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3282  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  52.88 
 
 		 324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0926  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  56.15 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2252  L-threonine ammonia-lyase  56.15 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2244  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  54.49 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.603637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1902  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  54.37 
 
 		 327 aa  273  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  48.38 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3217  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  49.69 
 
 		 324 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555071  normal  0.861719 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0647  L-threonine ammonia-lyase  51.27 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  42.07 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1660  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  50.16 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0211382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2702  putative threonine dehydratase  50.79 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0996  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.8 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.73 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4825  serine/threonine dehydratase  44.48 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00349984  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2122  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.83 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113848  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0152  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  48.74 
 
 		 318 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3024  serine/threonine dehydratase  44.48 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1698  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.82 
 
 		 328 aa  238  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4000  serine/threonine dehydratase  44.13 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4113  serine/threonine dehydratase  44.13 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.559381  normal  0.528842 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0755  serine/threonine dehydratase  44.16 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284278  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2154  serine/threonine dehydratase  44.16 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3108  serine/threonine dehydratase  44.16 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2024  serine/threonine dehydratase  44.16 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3078  serine/threonine dehydratase  44.16 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2589  serine/threonine dehydratase  44.16 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1524  serine/threonine dehydratase  44.27 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00616628  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5857  serine/threonine dehydratase  44.21 
 
 		 324 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3918  serine/threonine dehydratase  44.21 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4450  serine/threonine dehydratase  44.21 
 
 		 324 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  43.45 
 
 		 405 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1493  serine/threonine dehydratase  44.21 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1999  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.53 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal  0.0256185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3519  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.67 
 
 		 339 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00283546  normal  0.133146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1894  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  45.57 
 
 		 324 aa  229  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0510457  normal  0.19276 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4347  serine/threonine dehydratase  43.56 
 
 		 322 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4607  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.8 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3882  serine/threonine dehydratase  43.9 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0375891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4343  serine/threonine dehydratase  43.9 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  39.62 
 
 		 403 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3470  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.96 
 
 		 318 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.380484  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2250  serine/threonine dehydratase  43.35 
 
 		 324 aa  225  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4565  serine/threonine dehydratase  42.99 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.026373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5756  serine/threonine dehydratase  43.79 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000717119  hitchhiker  0.000000000000616455 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3783  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.81 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.930239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04793  serine/threonine dehydratase  42.59 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.821388  normal  0.0296686 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.82 
 
 		 332 aa  222  8e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0305  serine/threonine dehydratase  40.58 
 
 		 322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.93 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29410  serine/threonine dehydratase  45.94 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3215  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  43.73 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2556  serine/threonine dehydratase  42.41 
 
 		 324 aa  219  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  41.56 
 
 		 401 aa  215  7e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  41.56 
 
 		 401 aa  215  7e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4177  serine/threonine dehydratase  43.87 
 
 		 326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0534  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  42.9 
 
 		 321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3108  serine/threonine dehydratase  44.52 
 
 		 321 aa  212  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0886  serine/threonine dehydratase  44.07 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  42.19 
 
 		 408 aa  209  5e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1807  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.87 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  36.62 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  42.72 
 
 		 514 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  36.27 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  35.28 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  35.6 
 
 		 403 aa  199  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  39.31 
 
 		 402 aa  199  6e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  34.95 
 
 		 403 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  40.19 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10990  threonine dehydratase  45.26 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  35.95 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  41.27 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  35.69 
 
 		 403 aa  194  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  40.97 
 
 		 399 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  41.42 
 
 		 506 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.46 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  43.37 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  40.61 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3920  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.5 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  41.42 
 
 		 506 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.58 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  39.56 
 
 		 403 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  39.3 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1389  putative threonine dehydratase  33.97 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  38.59 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  36.22 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  36.84 
 
 		 395 aa  189  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>