More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2925 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  100 
 
 		 318 aa  640    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  56.9 
 
 		 321 aa  341  7e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  57.24 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4146  hypothetical protein  53.11 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3798  hypothetical protein  53.11 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0008  hypothetical protein  52.79 
 
 		 320 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2525  hypothetical protein  51.6 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0335353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2674  hypothetical protein  50.8 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3191  hypothetical protein  51.28 
 
 		 350 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0037  hypothetical protein  50 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  41.37 
 
 		 509 aa  237  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  41.99 
 
 		 405 aa  235  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  41.46 
 
 		 501 aa  232  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  41.14 
 
 		 503 aa  231  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  37.62 
 
 		 403 aa  229  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  40.8 
 
 		 507 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  37.79 
 
 		 511 aa  225  6e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  37.79 
 
 		 511 aa  225  8e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  41.81 
 
 		 526 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  37.66 
 
 		 514 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  37.33 
 
 		 513 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  39.1 
 
 		 403 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  40.8 
 
 		 520 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  40.26 
 
 		 507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  43 
 
 		 506 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  37.79 
 
 		 511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  43 
 
 		 506 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  42.67 
 
 		 503 aa  219  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  40.47 
 
 		 514 aa  218  7.999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  44.05 
 
 		 402 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  39.62 
 
 		 509 aa  218  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  39.67 
 
 		 515 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  40.32 
 
 		 403 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  40.47 
 
 		 510 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  41.51 
 
 		 502 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2325  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.82 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213895 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  38.99 
 
 		 504 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  43.87 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  43.73 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  43.73 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  40.13 
 
 		 529 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  38.59 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  41.83 
 
 		 505 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  39.55 
 
 		 402 aa  209  4e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  40.19 
 
 		 400 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  38.49 
 
 		 549 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  39.1 
 
 		 403 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  43.05 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  39.87 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  39.42 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5602  putative threonine dehydratase  40.84 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  40.84 
 
 		 401 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  36.86 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  40.84 
 
 		 401 aa  206  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  34.94 
 
 		 403 aa  206  4e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  39.42 
 
 		 403 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  37.11 
 
 		 403 aa  206  4e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  37.5 
 
 		 606 aa  206  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  40.91 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  40.63 
 
 		 414 aa  205  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  37.79 
 
 		 503 aa  206  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  40.51 
 
 		 514 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  37.46 
 
 		 504 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4430  threonine dehydratase  40.69 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000773933 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  36.54 
 
 		 403 aa  205  9e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  37.46 
 
 		 504 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  41.35 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  36.22 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2906  threonine dehydratase  39.3 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  36.22 
 
 		 403 aa  203  3e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2297  threonine dehydratase  40.38 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2260  threonine dehydratase  40.38 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00014617  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  38.26 
 
 		 403 aa  203  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  40.19 
 
 		 509 aa  203  3e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2469  threonine dehydratase  40.38 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1311  threonine dehydratase, biosynthetic  42.02 
 
 		 503 aa  203  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.484078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2486  threonine dehydratase  40.38 
 
 		 333 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2424  threonine dehydratase  39.1 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  41.03 
 
 		 333 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2218  threonine dehydratase  40.71 
 
 		 333 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  37.94 
 
 		 402 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  36.48 
 
 		 501 aa  202  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  38.13 
 
 		 515 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  40.58 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0892  threonine dehydratase  37.67 
 
 		 515 aa  202  9e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.14 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  35.37 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4909  threonine dehydratase  41.08 
 
 		 527 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6650  threonine dehydratase  44.07 
 
 		 323 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.987033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  36.02 
 
 		 408 aa  200  3e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2603  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.5 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000516286  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  40.95 
 
 		 408 aa  200  3e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  38.49 
 
 		 527 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  36.66 
 
 		 401 aa  200  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  42.63 
 
 		 413 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.89 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3469  threonine dehydratase  40.92 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  36.33 
 
 		 507 aa  199  7e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  40.56 
 
 		 408 aa  198  9e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09531  threonine dehydratase  37.33 
 
 		 513 aa  198  9e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>