More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0037 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0037  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3798  hypothetical protein  73.58 
 
 		 320 aa  455  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0008  hypothetical protein  73.27 
 
 		 320 aa  454  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4146  hypothetical protein  73.27 
 
 		 320 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2674  hypothetical protein  61.51 
 
 		 325 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2525  hypothetical protein  61.83 
 
 		 333 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0335353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3191  hypothetical protein  61.2 
 
 		 350 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  44.97 
 
 		 321 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  43.96 
 
 		 321 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  50 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  38.87 
 
 		 405 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  35.83 
 
 		 402 aa  209  4e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3920  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.36 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.903955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.95 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2700  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.39 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  35.18 
 
 		 402 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3309  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.04 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0279719  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  38.57 
 
 		 507 aa  200  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.66 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3217  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.51 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555071  normal  0.861719 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme beta subunit  38.14 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.11 
 
 		 320 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2122  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.33 
 
 		 332 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113848  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2603  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.39 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000516286  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.64 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  40.07 
 
 		 400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  36.96 
 
 		 509 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  39.16 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4366  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.07 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  34.42 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4565  serine/threonine dehydratase  35.22 
 
 		 320 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.026373 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.51 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0888  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.09 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  37.01 
 
 		 402 aa  192  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.97 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  36.07 
 
 		 403 aa  192  7e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29410  serine/threonine dehydratase  37.54 
 
 		 320 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  34.71 
 
 		 403 aa  190  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2556  serine/threonine dehydratase  34.95 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0980  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.29 
 
 		 326 aa  189  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  35.74 
 
 		 403 aa  189  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  38.64 
 
 		 501 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3918  serine/threonine dehydratase  35.28 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4450  serine/threonine dehydratase  35.28 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  39.8 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  39.8 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  35.74 
 
 		 403 aa  188  8e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1389  putative threonine dehydratase  34.29 
 
 		 326 aa  189  8e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  37.21 
 
 		 520 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  37.5 
 
 		 509 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  38.36 
 
 		 506 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  38.36 
 
 		 506 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1844  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.76 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  35.48 
 
 		 400 aa  187  2e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5857  serine/threonine dehydratase  34.95 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  37.86 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2250  serine/threonine dehydratase  34.63 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63083  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  37.42 
 
 		 504 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  37.86 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4343  serine/threonine dehydratase  34.63 
 
 		 324 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  37.86 
 
 		 346 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3882  serine/threonine dehydratase  34.63 
 
 		 324 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0375891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  37.42 
 
 		 504 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4177  serine/threonine dehydratase  35.28 
 
 		 326 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  40.14 
 
 		 510 aa  186  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1807  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.29 
 
 		 322 aa  186  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  39.12 
 
 		 516 aa  186  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4888  putative threonine dehydratase, catabolic  34.09 
 
 		 325 aa  185  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1148  putative serine/threonine dehydratase  37.59 
 
 		 320 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.697315  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  35.16 
 
 		 517 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  34.84 
 
 		 517 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  35.99 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2906  threonine dehydratase  37.62 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  35.02 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  35.99 
 
 		 402 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  40.14 
 
 		 516 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1722  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.03 
 
 		 320 aa  183  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  34.97 
 
 		 424 aa  183  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  34.65 
 
 		 403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  33.86 
 
 		 329 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5756  serine/threonine dehydratase  35.6 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000717119  hitchhiker  0.000000000000616455 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  35.41 
 
 		 402 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1698  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.28 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1493  serine/threonine dehydratase  34.3 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3695  threonine dehydratase  35.65 
 
 		 334 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  38.96 
 
 		 501 aa  182  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2424  threonine dehydratase  37.3 
 
 		 333 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3783  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.3 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.930239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  39.1 
 
 		 515 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1524  serine/threonine dehydratase  33.33 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00616628  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  37.42 
 
 		 515 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  37.29 
 
 		 515 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2502  threonine dehydratase  37.3 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0237759  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2154  serine/threonine dehydratase  33.01 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2589  serine/threonine dehydratase  33.01 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2024  serine/threonine dehydratase  33.01 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3024  serine/threonine dehydratase  33.01 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0656  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.86 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.360995  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2565  threonine dehydratase  37.94 
 
 		 333 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0373564  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3078  serine/threonine dehydratase  33.01 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>