More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3189 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3189  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  660    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2225  hypothetical protein  65.61 
 
 		 318 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  56.77 
 
 		 328 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6086  hypothetical protein  57.42 
 
 		 327 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3855  hypothetical protein  55.7 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3254  hypothetical protein  56.13 
 
 		 330 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.897586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3749  hypothetical protein  58.28 
 
 		 323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3226  hypothetical protein  54.92 
 
 		 316 aa  316  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53260  hypothetical protein  49.53 
 
 		 320 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.845489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4669  hypothetical protein  50 
 
 		 320 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.838467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0819  hypothetical protein  48.87 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  48.84 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0738  hypothetical protein  48.12 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4441  hypothetical protein  50.16 
 
 		 339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0890  hypothetical protein  47.59 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4245  hypothetical protein  47.39 
 
 		 335 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0948  hypothetical protein  49.84 
 
 		 334 aa  262  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4911  hypothetical protein  46.3 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.301793  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3120  hypothetical protein  47.62 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3847  hypothetical protein  47.62 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.2 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  36.67 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  34.65 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  35.42 
 
 		 403 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  34.22 
 
 		 403 aa  166  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4825  serine/threonine dehydratase  35.33 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00349984  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  34.88 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  34.88 
 
 		 403 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  34.55 
 
 		 403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  33.22 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  33.96 
 
 		 402 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  31.79 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  32.26 
 
 		 408 aa  160  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  35.42 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  34.27 
 
 		 403 aa  159  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  34.64 
 
 		 403 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  32.92 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  35.94 
 
 		 402 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  31.13 
 
 		 404 aa  155  9e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5857  serine/threonine dehydratase  33.86 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3918  serine/threonine dehydratase  33.86 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4450  serine/threonine dehydratase  33.86 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0816  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.79 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4633  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.13 
 
 		 315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.03 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  35.74 
 
 		 403 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1146  threonine dehydratase  38.06 
 
 		 423 aa  152  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0807272  normal  0.0946601 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  35.49 
 
 		 402 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  33.76 
 
 		 402 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  35.39 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  32.67 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  31.99 
 
 		 510 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3191  hypothetical protein  38.26 
 
 		 350 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  35.35 
 
 		 516 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  35.11 
 
 		 403 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2525  hypothetical protein  38.26 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0335353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  35.33 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  36.05 
 
 		 403 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  32.04 
 
 		 515 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5756  serine/threonine dehydratase  33.75 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000717119  hitchhiker  0.000000000000616455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  34.48 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4343  serine/threonine dehydratase  32.28 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3882  serine/threonine dehydratase  32.28 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0375891 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  32.51 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  32.38 
 
 		 401 aa  145  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  31.94 
 
 		 514 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  34.22 
 
 		 545 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  36.02 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  31.39 
 
 		 515 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  33.95 
 
 		 403 aa  144  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1524  serine/threonine dehydratase  33.77 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00616628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3772  threonine dehydratase  31.33 
 
 		 514 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.450956  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  35.2 
 
 		 409 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3024  serine/threonine dehydratase  33.77 
 
 		 327 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  34.6 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2589  serine/threonine dehydratase  33.77 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2154  serine/threonine dehydratase  33.77 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3108  serine/threonine dehydratase  33.77 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0755  serine/threonine dehydratase  33.77 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.284278  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2024  serine/threonine dehydratase  33.77 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  33.23 
 
 		 403 aa  142  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  34.77 
 
 		 412 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3078  serine/threonine dehydratase  33.77 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.642158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29410  serine/threonine dehydratase  32.78 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  34.86 
 
 		 412 aa  142  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4565  serine/threonine dehydratase  31.33 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.026373 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  31.76 
 
 		 522 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  31.95 
 
 		 511 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4028  threonine dehydratase  30.33 
 
 		 514 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.749661  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1493  serine/threonine dehydratase  31.66 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  31.25 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1698  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.49 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  28.97 
 
 		 402 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  31.65 
 
 		 511 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3798  hypothetical protein  31.31 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  33.97 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0486  threonine dehydratase  31.99 
 
 		 514 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.824799  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4056  threonine dehydratase  31.99 
 
 		 514 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0158  threonine dehydratase  31.99 
 
 		 514 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  33.11 
 
 		 531 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>