More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0128 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 343 aa  688    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  46.22 
 
 		 403 aa  267  2e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  44.38 
 
 		 418 aa  251  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  46.53 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1029  threonine dehydratase  48.04 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010709 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1533  threonine dehydratase  46.22 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.331802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  39.64 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  40.85 
 
 		 408 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  37.06 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  38.49 
 
 		 403 aa  204  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  37.38 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  38.54 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  36.72 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  36.1 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  37.72 
 
 		 403 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.73 
 
 		 320 aa  192  6e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  38.44 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  38.02 
 
 		 403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  35.65 
 
 		 402 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  41.08 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  37.38 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  36.83 
 
 		 415 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  37.58 
 
 		 401 aa  185  8e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3864  threonine dehydratase  35.95 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  39.06 
 
 		 395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.14 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  33.44 
 
 		 408 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  38.94 
 
 		 511 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  38.73 
 
 		 416 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  37.27 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  34.65 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  38.94 
 
 		 511 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  34.75 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  34.85 
 
 		 403 aa  178  9e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  38.71 
 
 		 401 aa  178  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  38.08 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  37.06 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  38.61 
 
 		 514 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  37.06 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  36.05 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  38.54 
 
 		 403 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  38.24 
 
 		 407 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  38.39 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0056  threonine dehydratase  34.36 
 
 		 344 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  35.9 
 
 		 411 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  39.94 
 
 		 404 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  38.21 
 
 		 403 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  38.25 
 
 		 401 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  38.25 
 
 		 401 aa  170  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  35.24 
 
 		 417 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  35.56 
 
 		 402 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  36.33 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  37.46 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  32.7 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  33.23 
 
 		 403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  32.75 
 
 		 520 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  37.27 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  32.92 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  33.55 
 
 		 501 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10990  threonine dehydratase  37.93 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  38.81 
 
 		 412 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 424 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  37.12 
 
 		 399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  32.92 
 
 		 403 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1720  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.68 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  35.26 
 
 		 402 aa  162  7e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  32.92 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  35.67 
 
 		 421 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3022  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.66 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.380289  normal  0.480541 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  32.3 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  32.41 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  35.58 
 
 		 404 aa  159  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31740  predicted protein  34.24 
 
 		 468 aa  159  8e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.414163 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  33.66 
 
 		 323 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  34.21 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  33.66 
 
 		 323 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  37.58 
 
 		 404 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  32.43 
 
 		 415 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.52 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.18 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  36.65 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  35.55 
 
 		 403 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  35.15 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  35.76 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4294  threonine dehydratase  35.34 
 
 		 425 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  35.06 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  40.76 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3469  threonine dehydratase  36.77 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  36.93 
 
 		 403 aa  156  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  36.04 
 
 		 537 aa  156  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  34.26 
 
 		 513 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  32.6 
 
 		 416 aa  155  7e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  35.42 
 
 		 412 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  32.05 
 
 		 408 aa  155  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  34.98 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  35.46 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  35.35 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  36.33 
 
 		 509 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>