More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3678 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  100 
 
 		 437 aa  907    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  76.46 
 
 		 424 aa  681    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  61.95 
 
 		 417 aa  524  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  59.27 
 
 		 423 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  57.32 
 
 		 423 aa  491  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  57.28 
 
 		 418 aa  482  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  55.37 
 
 		 415 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  56.42 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  56.48 
 
 		 420 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  55.61 
 
 		 420 aa  461  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  55.37 
 
 		 420 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  56.44 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  55.61 
 
 		 420 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  55.61 
 
 		 420 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  55.61 
 
 		 420 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  55.37 
 
 		 420 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  55.37 
 
 		 420 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  55.61 
 
 		 420 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  54.88 
 
 		 412 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  55.12 
 
 		 420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  50.62 
 
 		 422 aa  425  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  45.89 
 
 		 416 aa  410  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  50.72 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  50.72 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  47.16 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  48.55 
 
 		 426 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  48.12 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  48.55 
 
 		 426 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  48.55 
 
 		 426 aa  385  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  47.43 
 
 		 413 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  46.47 
 
 		 415 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  47.37 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  45.37 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  46.08 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  45.59 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  48 
 
 		 408 aa  363  4e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  46.78 
 
 		 429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  46.35 
 
 		 415 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  47.42 
 
 		 418 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  47.06 
 
 		 415 aa  352  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  48.42 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  46.27 
 
 		 412 aa  347  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  45.1 
 
 		 431 aa  341  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  45.97 
 
 		 439 aa  338  8e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  44.55 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  44.04 
 
 		 437 aa  333  5e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  45.94 
 
 		 408 aa  332  7.000000000000001e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  43.44 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  45.74 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  43.92 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  37.97 
 
 		 507 aa  273  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  36.48 
 
 		 503 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  37.15 
 
 		 514 aa  265  1e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  35.77 
 
 		 514 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  36.91 
 
 		 526 aa  263  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  39.11 
 
 		 506 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  37.84 
 
 		 509 aa  263  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  39.11 
 
 		 506 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  38.58 
 
 		 504 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  38.94 
 
 		 507 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  35.68 
 
 		 509 aa  260  3e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  36.36 
 
 		 513 aa  260  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  38.72 
 
 		 402 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  35.12 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  37.23 
 
 		 507 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  37.94 
 
 		 501 aa  257  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  35.12 
 
 		 511 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  40.8 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  37.82 
 
 		 606 aa  255  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  36.51 
 
 		 511 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  35.58 
 
 		 503 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  36.59 
 
 		 507 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  36.59 
 
 		 507 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  36.59 
 
 		 507 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  37.88 
 
 		 402 aa  253  7e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  37.27 
 
 		 504 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  37.27 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  37.78 
 
 		 516 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  38.58 
 
 		 506 aa  250  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  38.5 
 
 		 515 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  35.29 
 
 		 501 aa  247  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  37.47 
 
 		 503 aa  245  9.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  34.59 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  39.69 
 
 		 529 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0413  threonine dehydratase  37.94 
 
 		 519 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  37.7 
 
 		 505 aa  244  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  37.9 
 
 		 520 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  37.96 
 
 		 504 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  37.96 
 
 		 504 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  36.8 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  40 
 
 		 550 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  37.96 
 
 		 504 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0354  threonine dehydratase  38.75 
 
 		 565 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  38.54 
 
 		 505 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  38.66 
 
 		 549 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  37.14 
 
 		 517 aa  240  4e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  37.44 
 
 		 502 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  37.17 
 
 		 504 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  35.08 
 
 		 507 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  36.77 
 
 		 515 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>