More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1924 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  100 
 
 		 418 aa  861    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  65.7 
 
 		 414 aa  554  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  62.75 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  60.54 
 
 		 424 aa  511  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  63.39 
 
 		 420 aa  502  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  57.28 
 
 		 437 aa  502  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  62.01 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  62.01 
 
 		 420 aa  494  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  62.01 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  62.01 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  62.01 
 
 		 420 aa  495  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  62.01 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  61.76 
 
 		 420 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  61.52 
 
 		 412 aa  490  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  61.76 
 
 		 420 aa  490  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  60.05 
 
 		 423 aa  485  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  61.27 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  60.78 
 
 		 423 aa  484  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  54.37 
 
 		 422 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  57.74 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  56.37 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  53.57 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  53.57 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  49.15 
 
 		 416 aa  427  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  49.4 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  49.4 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  50.12 
 
 		 421 aa  398  9.999999999999999e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  49.4 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  48.17 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  45.99 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  47.17 
 
 		 416 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  45.5 
 
 		 416 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  47.56 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  47.09 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  45.12 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  46.12 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  47 
 
 		 429 aa  362  8e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  45.23 
 
 		 418 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  49.88 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  46.9 
 
 		 437 aa  352  5e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  45.68 
 
 		 408 aa  352  8.999999999999999e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  45.19 
 
 		 404 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  47.55 
 
 		 431 aa  349  6e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  48.47 
 
 		 408 aa  348  9e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  45.28 
 
 		 415 aa  342  5.999999999999999e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  42.76 
 
 		 457 aa  332  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  44.99 
 
 		 412 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  47.52 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  43.6 
 
 		 439 aa  326  5e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  43.28 
 
 		 425 aa  325  8.000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  39.8 
 
 		 506 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  39.8 
 
 		 506 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  38.92 
 
 		 511 aa  278  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  38.52 
 
 		 511 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  38.24 
 
 		 514 aa  272  7e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  38.52 
 
 		 511 aa  272  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  38.14 
 
 		 507 aa  272  9e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 515 aa  272  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  39.85 
 
 		 515 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  37.63 
 
 		 507 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  37.63 
 
 		 507 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  37.37 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  37.63 
 
 		 507 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  38.4 
 
 		 516 aa  266  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  36.73 
 
 		 507 aa  265  8e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  38.04 
 
 		 509 aa  263  4e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  39.13 
 
 		 606 aa  263  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  41.69 
 
 		 504 aa  263  6e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  36.86 
 
 		 503 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  36.18 
 
 		 503 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  37.99 
 
 		 517 aa  260  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  37.98 
 
 		 501 aa  259  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  36.73 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  37.47 
 
 		 517 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  35.61 
 
 		 507 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  37.05 
 
 		 504 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  37.05 
 
 		 504 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  36.48 
 
 		 514 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  39.74 
 
 		 522 aa  255  9e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  35.82 
 
 		 526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  37 
 
 		 531 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  38.68 
 
 		 506 aa  252  7e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0413  threonine dehydratase  36.11 
 
 		 519 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  37.19 
 
 		 514 aa  250  3e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  38.01 
 
 		 503 aa  250  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  37.5 
 
 		 509 aa  249  8e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  37.76 
 
 		 535 aa  249  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  38.99 
 
 		 510 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0662  threonine dehydratase  37.63 
 
 		 507 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  37.89 
 
 		 507 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2766  threonine dehydratase  37.89 
 
 		 507 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0677  threonine dehydratase  37.89 
 
 		 507 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  39.03 
 
 		 502 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2312  threonine dehydratase  37.89 
 
 		 507 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  37.89 
 
 		 507 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  38.69 
 
 		 509 aa  247  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5602  putative threonine dehydratase  42.21 
 
 		 363 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0840  threonine dehydratase  37.63 
 
 		 507 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  37.24 
 
 		 507 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2787  threonine dehydratase  38.14 
 
 		 507 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>