More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3429 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  100 
 
 		 414 aa  847    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  65.7 
 
 		 418 aa  556  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  60.64 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  58.66 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  57.43 
 
 		 424 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  56.44 
 
 		 437 aa  481  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  60.64 
 
 		 423 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  59.31 
 
 		 420 aa  474  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  58.25 
 
 		 420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  58.25 
 
 		 420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  57.92 
 
 		 420 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  57.92 
 
 		 420 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  57.67 
 
 		 412 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  57.43 
 
 		 420 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  57.67 
 
 		 420 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  57.67 
 
 		 420 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  57.67 
 
 		 420 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  57.67 
 
 		 420 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  52.63 
 
 		 422 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  56.68 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  56.44 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  54.07 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  54.07 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  50.86 
 
 		 416 aa  431  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  48.66 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  48.66 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  48.66 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  49.37 
 
 		 420 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  49.28 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  46.79 
 
 		 415 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  48.9 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  48 
 
 		 415 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  46.83 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  48.08 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  47.18 
 
 		 416 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  47.19 
 
 		 416 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  46.94 
 
 		 416 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  47.92 
 
 		 423 aa  353  5e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  48.13 
 
 		 412 aa  352  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  47.56 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  45.67 
 
 		 408 aa  346  4e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  46.21 
 
 		 437 aa  346  5e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  49.03 
 
 		 429 aa  344  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  46.3 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  44.15 
 
 		 418 aa  342  1e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  44.9 
 
 		 457 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  43.84 
 
 		 404 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  46.55 
 
 		 408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  45.35 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  43.34 
 
 		 415 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  39.65 
 
 		 506 aa  285  9e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  39.65 
 
 		 506 aa  285  9e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  38.13 
 
 		 511 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  37.88 
 
 		 511 aa  278  9e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  38.69 
 
 		 503 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  37.2 
 
 		 514 aa  274  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  37.4 
 
 		 507 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  40.8 
 
 		 516 aa  265  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  37.12 
 
 		 509 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  36.71 
 
 		 511 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  39.35 
 
 		 505 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  36.93 
 
 		 505 aa  260  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  35.82 
 
 		 503 aa  259  6e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  39.18 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  36.29 
 
 		 513 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  35.11 
 
 		 507 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  35.18 
 
 		 526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  35.59 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  35.59 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  36.55 
 
 		 515 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  36.3 
 
 		 506 aa  252  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  35.93 
 
 		 501 aa  252  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  34.42 
 
 		 507 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  36.04 
 
 		 515 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  35.35 
 
 		 514 aa  251  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  37.84 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  35.14 
 
 		 606 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  33.91 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  33.66 
 
 		 507 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  38.42 
 
 		 510 aa  250  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  33.91 
 
 		 507 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  33.91 
 
 		 507 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  38.07 
 
 		 523 aa  249  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  35.77 
 
 		 509 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  35.66 
 
 		 531 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  36.39 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  35.09 
 
 		 520 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  36.18 
 
 		 503 aa  246  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  36.11 
 
 		 401 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  33.17 
 
 		 515 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  38.79 
 
 		 517 aa  244  3e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  33.09 
 
 		 527 aa  243  3e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  38.38 
 
 		 510 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5602  putative threonine dehydratase  40.13 
 
 		 363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  36.9 
 
 		 403 aa  243  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  37.25 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  36.9 
 
 		 403 aa  243  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  38.26 
 
 		 517 aa  243  6e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  33.09 
 
 		 549 aa  243  7e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4909  threonine dehydratase  36.32 
 
 		 527 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>