More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2990 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  100 
 
 		 457 aa  921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  68.02 
 
 		 439 aa  523  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  59.74 
 
 		 429 aa  521  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  59.21 
 
 		 426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  59.21 
 
 		 426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  59.21 
 
 		 426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  58.42 
 
 		 429 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  60.14 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  61.33 
 
 		 429 aa  478  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  53.85 
 
 		 431 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  53.59 
 
 		 437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  54.38 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  45.23 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  43.33 
 
 		 420 aa  361  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  42.5 
 
 		 417 aa  360  4e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  43.33 
 
 		 420 aa  358  8e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  43.09 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  43.33 
 
 		 420 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  43.33 
 
 		 420 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  47.1 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  43.09 
 
 		 420 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  43.09 
 
 		 420 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  43.22 
 
 		 420 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  43.09 
 
 		 420 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  42.62 
 
 		 412 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 420 aa  354  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  46.93 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  45 
 
 		 414 aa  353  4e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  43.44 
 
 		 437 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  40.84 
 
 		 422 aa  351  2e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  42.76 
 
 		 418 aa  349  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  42.29 
 
 		 416 aa  345  1e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  41.06 
 
 		 414 aa  341  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  44.23 
 
 		 415 aa  339  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  40.57 
 
 		 422 aa  320  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  40.57 
 
 		 422 aa  320  5e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  43.45 
 
 		 415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  43.96 
 
 		 415 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  43.53 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  38.67 
 
 		 421 aa  299  7e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  40.62 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  45.95 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  43.57 
 
 		 412 aa  292  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  39.36 
 
 		 416 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  39.73 
 
 		 416 aa  286  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  43.94 
 
 		 408 aa  283  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 418 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  39.42 
 
 		 404 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  40.39 
 
 		 408 aa  256  7e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  39.85 
 
 		 415 aa  243  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  35.95 
 
 		 501 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  36.36 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  36.6 
 
 		 514 aa  226  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  37.68 
 
 		 516 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  36.52 
 
 		 506 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  36.52 
 
 		 506 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  35.41 
 
 		 511 aa  221  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  37.76 
 
 		 507 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  36.62 
 
 		 606 aa  219  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  37.47 
 
 		 505 aa  217  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  33.73 
 
 		 503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  34.43 
 
 		 509 aa  213  4.9999999999999996e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  36.12 
 
 		 509 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  36.96 
 
 		 531 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  36.25 
 
 		 504 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  34.74 
 
 		 520 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  36.25 
 
 		 504 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  35.34 
 
 		 526 aa  210  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  34.16 
 
 		 507 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  35.31 
 
 		 506 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  32.79 
 
 		 511 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  34.62 
 
 		 507 aa  208  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  32.3 
 
 		 514 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  32.32 
 
 		 511 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  34.63 
 
 		 515 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  35.61 
 
 		 504 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  32.71 
 
 		 549 aa  206  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 503 aa  206  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  34.16 
 
 		 507 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  33.91 
 
 		 507 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  37 
 
 		 504 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  34.42 
 
 		 507 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  36.17 
 
 		 501 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  36.75 
 
 		 504 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  37 
 
 		 504 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  34.62 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  34.16 
 
 		 506 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  36.75 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  37 
 
 		 504 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  31.87 
 
 		 403 aa  203  6e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  37.25 
 
 		 504 aa  202  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  35.35 
 
 		 505 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  36.79 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  34.44 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  38.02 
 
 		 503 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  36.97 
 
 		 545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  35.92 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  34.78 
 
 		 527 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  34.95 
 
 		 529 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  37.36 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>