More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1421 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  100 
 
 		 418 aa  846    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  69.31 
 
 		 404 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  68.8 
 
 		 408 aa  554  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  65.45 
 
 		 416 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  64.48 
 
 		 416 aa  545  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  64.96 
 
 		 416 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  65.45 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  59.81 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  59.33 
 
 		 415 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  63.01 
 
 		 412 aa  488  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  58.33 
 
 		 413 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  55.98 
 
 		 408 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  55.98 
 
 		 425 aa  438  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  45.83 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  47.42 
 
 		 437 aa  359  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  45.23 
 
 		 418 aa  345  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  45.43 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  44.02 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  43.06 
 
 		 423 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  44.15 
 
 		 414 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  41.53 
 
 		 414 aa  327  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  41.59 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  42.05 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  42.3 
 
 		 420 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  42.3 
 
 		 420 aa  323  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  42.05 
 
 		 420 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  39.17 
 
 		 416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  42.05 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  42.05 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  42.05 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  42.05 
 
 		 420 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  41.45 
 
 		 412 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  42.51 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  42.51 
 
 		 422 aa  318  9e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  42.16 
 
 		 420 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  42.05 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  42.2 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  46.51 
 
 		 426 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  46.51 
 
 		 426 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  46.51 
 
 		 426 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  48.76 
 
 		 420 aa  309  5e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  46.05 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  45.04 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  42.89 
 
 		 437 aa  277  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  43.14 
 
 		 423 aa  262  6.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  45.24 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  43.07 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  41.79 
 
 		 439 aa  249  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  37.76 
 
 		 514 aa  242  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  38.06 
 
 		 520 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  34.85 
 
 		 507 aa  229  7e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  35.35 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  37.87 
 
 		 515 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  35.1 
 
 		 501 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  37.37 
 
 		 505 aa  224  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  37.62 
 
 		 515 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  35.86 
 
 		 506 aa  224  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  35.86 
 
 		 506 aa  224  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  35.86 
 
 		 526 aa  222  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  36.11 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  33.84 
 
 		 503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  35.26 
 
 		 503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  32.77 
 
 		 514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  35.25 
 
 		 516 aa  220  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  35.1 
 
 		 507 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  34.85 
 
 		 507 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  35.77 
 
 		 509 aa  219  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  34.85 
 
 		 507 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  34.43 
 
 		 511 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  36.45 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  36.41 
 
 		 523 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  36.45 
 
 		 504 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  38.33 
 
 		 530 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  38.57 
 
 		 519 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  34.17 
 
 		 507 aa  215  9e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  38.33 
 
 		 519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  33.17 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  35.51 
 
 		 501 aa  209  6e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  37.69 
 
 		 505 aa  209  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  33.59 
 
 		 506 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  35.35 
 
 		 502 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  36.84 
 
 		 504 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  33.01 
 
 		 514 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  33.5 
 
 		 527 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  33.59 
 
 		 506 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  34.68 
 
 		 505 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  35.1 
 
 		 510 aa  206  5e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  35.1 
 
 		 503 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  31.31 
 
 		 511 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  33.82 
 
 		 529 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4909  threonine dehydratase  35.35 
 
 		 527 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1900  threonine dehydratase, biosynthetic  33.84 
 
 		 506 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  32.69 
 
 		 509 aa  203  4e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  36.59 
 
 		 504 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  35.98 
 
 		 606 aa  203  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  36.45 
 
 		 504 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  36.45 
 
 		 504 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  36.45 
 
 		 504 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>