More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1373 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  77.29 
 
 		 416 aa  660    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  100 
 
 		 415 aa  837    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  76.33 
 
 		 416 aa  655    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  73.67 
 
 		 416 aa  624  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  66.83 
 
 		 404 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  65.45 
 
 		 418 aa  534  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  64.99 
 
 		 408 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  61.5 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  60.68 
 
 		 413 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  60.7 
 
 		 415 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  62.77 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  58.66 
 
 		 425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  57.49 
 
 		 408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  47.3 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  47.3 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  45.28 
 
 		 418 aa  346  4e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  44.02 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  41.53 
 
 		 422 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  43.34 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  39.28 
 
 		 416 aa  320  3e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  43.24 
 
 		 423 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  41.83 
 
 		 415 aa  319  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  43.24 
 
 		 423 aa  315  9e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  42.03 
 
 		 420 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  41.11 
 
 		 420 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  41.11 
 
 		 420 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  41.53 
 
 		 422 aa  311  9e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  41.53 
 
 		 422 aa  311  9e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  43.13 
 
 		 426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  43.13 
 
 		 426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  40.87 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  43.13 
 
 		 426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  40.87 
 
 		 412 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  40.87 
 
 		 420 aa  308  9e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  40.87 
 
 		 420 aa  308  9e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  40.87 
 
 		 420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  40.62 
 
 		 420 aa  306  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  41.4 
 
 		 420 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  40.62 
 
 		 420 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  44.33 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  40.87 
 
 		 414 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  44.33 
 
 		 420 aa  289  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  44.33 
 
 		 429 aa  285  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  44.89 
 
 		 429 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  41.22 
 
 		 437 aa  266  4e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  36.04 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  42.75 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  41.16 
 
 		 423 aa  257  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  40.24 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  39.85 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  38.67 
 
 		 523 aa  226  6e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  37.75 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  37.31 
 
 		 509 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  34.95 
 
 		 503 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  37.5 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  36.25 
 
 		 506 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  36.25 
 
 		 506 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  35.71 
 
 		 514 aa  216  5e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  36.99 
 
 		 507 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  39.09 
 
 		 504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  35.07 
 
 		 503 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  36.29 
 
 		 504 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  36.29 
 
 		 504 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  36.02 
 
 		 520 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  34.43 
 
 		 511 aa  208  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  32.69 
 
 		 517 aa  207  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  34.69 
 
 		 505 aa  207  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  33.93 
 
 		 509 aa  204  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  31.97 
 
 		 517 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  32.42 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  34.26 
 
 		 516 aa  203  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  36.49 
 
 		 501 aa  203  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  36.87 
 
 		 522 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  33.67 
 
 		 507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  32.01 
 
 		 507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  33.42 
 
 		 507 aa  201  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  36.78 
 
 		 504 aa  200  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  33.16 
 
 		 507 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  33.16 
 
 		 507 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  32.91 
 
 		 507 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  36.04 
 
 		 514 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  36.04 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  31.53 
 
 		 513 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  33.92 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  36.29 
 
 		 507 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  36.04 
 
 		 504 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  36.04 
 
 		 504 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  36.04 
 
 		 504 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  36.04 
 
 		 504 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  36.87 
 
 		 504 aa  196  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  35.43 
 
 		 510 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  35.79 
 
 		 504 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  36.31 
 
 		 606 aa  195  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  33.75 
 
 		 501 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  34.84 
 
 		 531 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  33.85 
 
 		 510 aa  194  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  35.03 
 
 		 504 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4909  threonine dehydratase  34.51 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  35.87 
 
 		 519 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  32.42 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>