More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1956 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  100 
 
 		 421 aa  863    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  53.98 
 
 		 416 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  48.82 
 
 		 422 aa  429  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  51.81 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  49.88 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  50.48 
 
 		 420 aa  409  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  50.72 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  50.72 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  50.72 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  50.96 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  50.96 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  50.72 
 
 		 420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  50.84 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  50.48 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  50.48 
 
 		 420 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  47.16 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  49.52 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  49.53 
 
 		 422 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  49.53 
 
 		 422 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  50.12 
 
 		 418 aa  397  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  47.96 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  49.52 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  48.9 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  47.24 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  45.01 
 
 		 414 aa  356  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  45.09 
 
 		 429 aa  342  8e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  44.58 
 
 		 426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  44.58 
 
 		 426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  44.58 
 
 		 426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  44.58 
 
 		 429 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  46.58 
 
 		 429 aa  323  4e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  38.76 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  44.01 
 
 		 420 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  41.01 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  44.17 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  41.33 
 
 		 415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  41.6 
 
 		 415 aa  298  9e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  42.24 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  37.2 
 
 		 416 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  42.37 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  39.66 
 
 		 404 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  38.62 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  38.59 
 
 		 416 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  41.69 
 
 		 408 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  39.68 
 
 		 418 aa  282  7.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  38.67 
 
 		 425 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  40 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  37.2 
 
 		 412 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  39.78 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  36.04 
 
 		 415 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  38.04 
 
 		 501 aa  249  5e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  35.98 
 
 		 513 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  37.89 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  39.02 
 
 		 504 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  35.17 
 
 		 511 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  35.17 
 
 		 511 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  36.86 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  37.01 
 
 		 507 aa  240  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  36.92 
 
 		 516 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  36.18 
 
 		 509 aa  238  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  35.35 
 
 		 503 aa  237  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  35.52 
 
 		 511 aa  237  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  35.34 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  35.34 
 
 		 517 aa  233  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  36.07 
 
 		 503 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  34.5 
 
 		 526 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  37.69 
 
 		 523 aa  230  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  35.79 
 
 		 514 aa  229  8e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  36.18 
 
 		 514 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  35.68 
 
 		 504 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  35.68 
 
 		 504 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  39.51 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  37.2 
 
 		 505 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  35.11 
 
 		 606 aa  226  6e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  36.24 
 
 		 509 aa  226  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  36.16 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  34.6 
 
 		 402 aa  226  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  37.39 
 
 		 408 aa  226  8e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  34.95 
 
 		 515 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  37.5 
 
 		 506 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  35.03 
 
 		 507 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0892  threonine dehydratase  35.82 
 
 		 515 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  34.78 
 
 		 506 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  34.78 
 
 		 506 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09531  threonine dehydratase  37.06 
 
 		 513 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  34.52 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  36 
 
 		 516 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  35.03 
 
 		 531 aa  223  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  34.73 
 
 		 522 aa  222  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  36.91 
 
 		 511 aa  222  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09511  threonine dehydratase  37.13 
 
 		 513 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.350493  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  33.49 
 
 		 520 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  37.13 
 
 		 515 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  34.09 
 
 		 515 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  34.24 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  34.64 
 
 		 403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  34.64 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  34.64 
 
 		 403 aa  219  6e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  33.68 
 
 		 403 aa  219  6e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  36.49 
 
 		 504 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>