More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1584 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  91.49 
 
 		 423 aa  796    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  100 
 
 		 423 aa  868    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  66.67 
 
 		 420 aa  578  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  66.67 
 
 		 420 aa  578  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  66.9 
 
 		 420 aa  579  1e-164  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  68.86 
 
 		 420 aa  578  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  66.67 
 
 		 420 aa  579  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  66.43 
 
 		 420 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  66.19 
 
 		 420 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  66.98 
 
 		 420 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  67.56 
 
 		 412 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  66.19 
 
 		 420 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  66.67 
 
 		 420 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  64.49 
 
 		 415 aa  552  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  61.71 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  64.08 
 
 		 417 aa  546  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  61.52 
 
 		 414 aa  517  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  57.32 
 
 		 437 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  60.05 
 
 		 418 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  60.64 
 
 		 414 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  55.29 
 
 		 422 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  49.88 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  53.94 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  53.94 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  49.52 
 
 		 421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  50.38 
 
 		 420 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  46.65 
 
 		 426 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  46.65 
 
 		 426 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  46.65 
 
 		 426 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  50.26 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  49.49 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  44.82 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  46.75 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  48.55 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  49.51 
 
 		 429 aa  363  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  44.75 
 
 		 415 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  44.25 
 
 		 416 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  46.5 
 
 		 437 aa  356  5.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  48.28 
 
 		 431 aa  355  8.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  46.93 
 
 		 457 aa  352  8.999999999999999e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  45.43 
 
 		 408 aa  352  8.999999999999999e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  48.15 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  43.06 
 
 		 418 aa  347  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  43.61 
 
 		 416 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  46.27 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  43.13 
 
 		 416 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  44.8 
 
 		 412 aa  342  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  43.35 
 
 		 404 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  41.48 
 
 		 507 aa  326  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  43.53 
 
 		 408 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  43.24 
 
 		 415 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  41.46 
 
 		 507 aa  312  6.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  40.49 
 
 		 511 aa  312  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  41.31 
 
 		 526 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  40.49 
 
 		 511 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  41.13 
 
 		 506 aa  305  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  39.55 
 
 		 507 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  42.89 
 
 		 516 aa  304  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  41.06 
 
 		 514 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  40.24 
 
 		 606 aa  302  6.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  39.01 
 
 		 513 aa  302  9e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 509 aa  302  9e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  41.51 
 
 		 506 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  41.51 
 
 		 506 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  39.41 
 
 		 509 aa  300  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  40.74 
 
 		 503 aa  300  4e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  39.29 
 
 		 507 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  39.04 
 
 		 507 aa  299  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  38.42 
 
 		 514 aa  298  9e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  40.89 
 
 		 504 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  39.03 
 
 		 503 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  39.29 
 
 		 507 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  38.9 
 
 		 511 aa  296  6e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  39.55 
 
 		 501 aa  295  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  42.13 
 
 		 517 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  41.88 
 
 		 517 aa  294  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  40.94 
 
 		 501 aa  293  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  38.67 
 
 		 504 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  38.67 
 
 		 504 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0645  threonine dehydratase  39.85 
 
 		 507 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.701109  normal  0.544724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  39.85 
 
 		 524 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  39.26 
 
 		 514 aa  290  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  39.27 
 
 		 524 aa  288  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  40.45 
 
 		 506 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  38.25 
 
 		 515 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4054  threonine dehydratase  39.27 
 
 		 535 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  37.87 
 
 		 549 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  38.92 
 
 		 515 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 506 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 509 aa  285  9e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  38.67 
 
 		 515 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  39.6 
 
 		 517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  41.31 
 
 		 502 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  41.56 
 
 		 503 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  41.81 
 
 		 505 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  40.39 
 
 		 523 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  39.04 
 
 		 507 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  37.62 
 
 		 527 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  39.41 
 
 		 504 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  38.2 
 
 		 529 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>