More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1447 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  90.21 
 
 
420 aa  768    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  89.74 
 
 
420 aa  763    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  89.54 
 
 
412 aa  747    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  90.45 
 
 
420 aa  760    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  89.74 
 
 
420 aa  763    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  89.74 
 
 
420 aa  761    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  89.74 
 
 
420 aa  763    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  100 
 
 
420 aa  861    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  89.74 
 
 
420 aa  763    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  89.74 
 
 
420 aa  761    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  90.21 
 
 
420 aa  763    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  68.86 
 
 
423 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  67.4 
 
 
423 aa  568  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  61.69 
 
 
417 aa  529  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  62.38 
 
 
415 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  59.66 
 
 
424 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  63.39 
 
 
418 aa  505  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  56.48 
 
 
437 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  55.61 
 
 
422 aa  479  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  59.31 
 
 
414 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  54.83 
 
 
416 aa  474  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  57.99 
 
 
414 aa  470  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  56.8 
 
 
422 aa  455  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  56.8 
 
 
422 aa  455  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  51.81 
 
 
421 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  48.02 
 
 
429 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  46.78 
 
 
426 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  46.78 
 
 
426 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  46.78 
 
 
426 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  44.99 
 
 
415 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  48.02 
 
 
413 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  45.5 
 
 
420 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  47.52 
 
 
429 aa  363  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  44.86 
 
 
415 aa  362  8e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  49.25 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  43.22 
 
 
457 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  45.39 
 
 
439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  46 
 
 
423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  43.59 
 
 
437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  42.75 
 
 
416 aa  342  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  44.75 
 
 
408 aa  342  5.999999999999999e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  44.64 
 
 
425 aa  339  4e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  42.03 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  43.14 
 
 
416 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  45.95 
 
 
431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  41.91 
 
 
418 aa  333  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  43.92 
 
 
412 aa  330  3e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  43.56 
 
 
404 aa  327  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  44.47 
 
 
408 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  41.4 
 
 
415 aa  303  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  39.8 
 
 
514 aa  295  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  39.8 
 
 
511 aa  289  5.0000000000000004e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  39.8 
 
 
511 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  38.27 
 
 
513 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  40.55 
 
 
606 aa  287  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  39.36 
 
 
503 aa  286  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  40.1 
 
 
503 aa  285  7e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  35.75 
 
 
507 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  43.27 
 
 
504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  41.83 
 
 
509 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  38.61 
 
 
509 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  40.2 
 
 
504 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  40.2 
 
 
504 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  39.03 
 
 
507 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  46.42 
 
 
505 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  38.37 
 
 
507 aa  282  9e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  39.54 
 
 
514 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  39.65 
 
 
506 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  39.65 
 
 
506 aa  281  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  35.51 
 
 
507 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  40.21 
 
 
516 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  40.16 
 
 
511 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  35.51 
 
 
507 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  35.28 
 
 
507 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  38.12 
 
 
526 aa  278  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  39.9 
 
 
501 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  39.26 
 
 
515 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  39.26 
 
 
515 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  37.84 
 
 
549 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  39.12 
 
 
523 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  39.78 
 
 
514 aa  273  5.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  37.97 
 
 
515 aa  272  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  39.44 
 
 
520 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  39.29 
 
 
509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  36.84 
 
 
527 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  39.69 
 
 
504 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  36.9 
 
 
507 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  41 
 
 
505 aa  269  7e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  41.09 
 
 
512 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  39.51 
 
 
506 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  35.44 
 
 
524 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  35.52 
 
 
524 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  36.89 
 
 
535 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1809  threonine dehydratase  39.31 
 
 
535 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0284  threonine dehydratase  39.58 
 
 
535 aa  265  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  36.21 
 
 
507 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1900  threonine dehydratase, biosynthetic  40.29 
 
 
506 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  36.21 
 
 
507 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  36.21 
 
 
507 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2312  threonine dehydratase  36.21 
 
 
507 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>