More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1003 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  100 
 
 		 415 aa  850    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  64.49 
 
 		 423 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  64.73 
 
 		 423 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  62.23 
 
 		 420 aa  537  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  62.47 
 
 		 420 aa  537  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  62.23 
 
 		 420 aa  537  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  62.23 
 
 		 420 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  62.47 
 
 		 420 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  62.2 
 
 		 412 aa  532  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  62.23 
 
 		 420 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  62.23 
 
 		 420 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  61.99 
 
 		 420 aa  532  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  62.38 
 
 		 420 aa  531  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  61.99 
 
 		 420 aa  534  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  60.63 
 
 		 417 aa  514  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  58.29 
 
 		 424 aa  508  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  55.37 
 
 		 437 aa  498  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  56.2 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  56.37 
 
 		 418 aa  458  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  56.44 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  52.28 
 
 		 422 aa  442  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  51.08 
 
 		 416 aa  437  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  51.92 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  51.92 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  47.24 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  49.49 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  49.49 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  49.49 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  49.5 
 
 		 420 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  47.43 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  49.61 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  45.57 
 
 		 415 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  49.61 
 
 		 429 aa  364  1e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  45.86 
 
 		 415 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  50.13 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  46.42 
 
 		 408 aa  350  4e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  46.25 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  42.62 
 
 		 416 aa  343  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  47.06 
 
 		 431 aa  339  5.9999999999999996e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  44.9 
 
 		 423 aa  338  8e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  45.78 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  46.02 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  43.29 
 
 		 457 aa  336  5.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  46.21 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  42.13 
 
 		 416 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  41.89 
 
 		 416 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  42.93 
 
 		 418 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  43.1 
 
 		 404 aa  319  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  42.93 
 
 		 415 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  43.36 
 
 		 408 aa  311  2e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  40.59 
 
 		 507 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  40.32 
 
 		 507 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  39.9 
 
 		 507 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  38.05 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  40.32 
 
 		 507 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  40.1 
 
 		 514 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  38.73 
 
 		 506 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  38.73 
 
 		 506 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  37.62 
 
 		 507 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  38.88 
 
 		 503 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  37.04 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  38.89 
 
 		 511 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  38.62 
 
 		 503 aa  280  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  40.16 
 
 		 526 aa  279  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  38.37 
 
 		 509 aa  279  7e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  39.53 
 
 		 606 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  38.89 
 
 		 511 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  39.7 
 
 		 501 aa  277  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  39.84 
 
 		 507 aa  278  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  39.01 
 
 		 509 aa  276  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  40.54 
 
 		 510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  39.75 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  41.5 
 
 		 402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  39.57 
 
 		 515 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  38.66 
 
 		 516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  38.05 
 
 		 513 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  36.99 
 
 		 511 aa  272  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  42.01 
 
 		 550 aa  272  9e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  40.21 
 
 		 524 aa  272  9e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  36.59 
 
 		 507 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  42.01 
 
 		 510 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4054  threonine dehydratase  40.21 
 
 		 535 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  38.62 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  37.63 
 
 		 505 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 507 aa  268  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  40 
 
 		 549 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  38.05 
 
 		 504 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  38.12 
 
 		 502 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2654  threonine dehydratase  40.27 
 
 		 507 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  39.74 
 
 		 507 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  38.05 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2787  threonine dehydratase  40.27 
 
 		 507 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  37.73 
 
 		 527 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  37.28 
 
 		 506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  39.43 
 
 		 535 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1144  threonine dehydratase  39.43 
 
 		 535 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15844  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  39.47 
 
 		 507 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  39.47 
 
 		 507 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  37.88 
 
 		 501 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  39 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>