More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0069 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  100 
 
 		 425 aa  865    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  68.43 
 
 		 415 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  68.67 
 
 		 415 aa  565  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  66.51 
 
 		 413 aa  545  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  64.82 
 
 		 408 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  61.69 
 
 		 412 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  59.51 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  59.26 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  58.5 
 
 		 416 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  57.28 
 
 		 418 aa  458  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  56.93 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  58.87 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  56.58 
 
 		 408 aa  425  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  46.77 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  47.62 
 
 		 423 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  46.3 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  44.89 
 
 		 424 aa  349  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  43.92 
 
 		 437 aa  343  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  46.15 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  43.06 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  42.72 
 
 		 420 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  42.72 
 
 		 420 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  42.72 
 
 		 420 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  42.49 
 
 		 420 aa  338  8e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  42.49 
 
 		 420 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  44.28 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  42.49 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  42.49 
 
 		 420 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  45.91 
 
 		 415 aa  335  9e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  42.42 
 
 		 420 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  43.42 
 
 		 412 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  42.25 
 
 		 420 aa  332  8e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  43.46 
 
 		 416 aa  331  2e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  43.28 
 
 		 418 aa  328  8e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  42.61 
 
 		 422 aa  324  1e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  43.73 
 
 		 422 aa  309  6.999999999999999e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  43.73 
 
 		 422 aa  309  6.999999999999999e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  48.14 
 
 		 420 aa  306  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  47.09 
 
 		 429 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  47.38 
 
 		 429 aa  292  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  44.67 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  44.67 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  44.67 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  45.31 
 
 		 457 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  44.68 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  38.67 
 
 		 421 aa  280  4e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  43.97 
 
 		 439 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  46.01 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  37.56 
 
 		 514 aa  253  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  43.24 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  42.57 
 
 		 437 aa  250  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  34.81 
 
 		 514 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  35.52 
 
 		 509 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  38.12 
 
 		 504 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  35.94 
 
 		 504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  35.94 
 
 		 504 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  34.98 
 
 		 511 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  33.66 
 
 		 511 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  35.94 
 
 		 505 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  35.82 
 
 		 520 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  34.32 
 
 		 511 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  37.96 
 
 		 505 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  33.82 
 
 		 507 aa  226  6e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  36.43 
 
 		 504 aa  226  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  34.24 
 
 		 501 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  33.91 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  36.41 
 
 		 511 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  35.91 
 
 		 515 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  35.75 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  36.59 
 
 		 504 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  36.43 
 
 		 507 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  36.34 
 
 		 504 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  36.34 
 
 		 504 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  36.34 
 
 		 504 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  36.34 
 
 		 504 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  34.6 
 
 		 506 aa  220  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  34.6 
 
 		 506 aa  220  5e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  36.34 
 
 		 504 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  34.08 
 
 		 526 aa  219  6e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  39.72 
 
 		 504 aa  219  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  36.34 
 
 		 514 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  34.41 
 
 		 507 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  34.49 
 
 		 503 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  33.09 
 
 		 513 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  34.73 
 
 		 507 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  34.48 
 
 		 507 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  36.16 
 
 		 523 aa  216  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  36.01 
 
 		 531 aa  216  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  33.74 
 
 		 509 aa  216  9e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  34.73 
 
 		 507 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  34.55 
 
 		 509 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  36.34 
 
 		 504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  36.6 
 
 		 506 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  33.83 
 
 		 507 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  33.82 
 
 		 517 aa  212  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  35.5 
 
 		 519 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4249  threonine dehydratase, biosynthetic  35.66 
 
 		 516 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.423735  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  36.74 
 
 		 606 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  36.21 
 
 		 530 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  36.21 
 
 		 519 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>