More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5911 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  100 
 
 		 424 aa  871    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  76.46 
 
 		 437 aa  681    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  62.93 
 
 		 423 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  63.9 
 
 		 417 aa  534  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  61.71 
 
 		 423 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  63.12 
 
 		 414 aa  515  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  59.27 
 
 		 420 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  59.51 
 
 		 420 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  59.02 
 
 		 412 aa  488  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  59.27 
 
 		 420 aa  490  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  59.27 
 
 		 420 aa  489  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  60.54 
 
 		 418 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  59.66 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  59.02 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  59.02 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  58.78 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  59.02 
 
 		 420 aa  487  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  58.29 
 
 		 415 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  58.78 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  57.43 
 
 		 414 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  50.71 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  53.25 
 
 		 422 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  53.25 
 
 		 422 aa  428  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  47.57 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  49.88 
 
 		 421 aa  395  1e-109  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  47.85 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  47.85 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  47.85 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  48.41 
 
 		 413 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  49.12 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  48.03 
 
 		 429 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  47.91 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  46.36 
 
 		 415 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  46.1 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  46.57 
 
 		 416 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  46.73 
 
 		 415 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  45.83 
 
 		 416 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  45.83 
 
 		 418 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  47.58 
 
 		 412 aa  357  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  48.18 
 
 		 429 aa  356  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  46.78 
 
 		 408 aa  351  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  47.16 
 
 		 439 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  45.23 
 
 		 457 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  47.3 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  45.54 
 
 		 404 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  47.3 
 
 		 415 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  46.9 
 
 		 437 aa  343  2e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  45.79 
 
 		 408 aa  338  9e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  46.08 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  44.89 
 
 		 425 aa  328  8e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  40.24 
 
 		 503 aa  296  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  41.44 
 
 		 507 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  38.68 
 
 		 509 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  38.73 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  38.21 
 
 		 503 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  39.15 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  38.46 
 
 		 511 aa  279  7e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  37.92 
 
 		 514 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  39.53 
 
 		 501 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  37.88 
 
 		 526 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  38.27 
 
 		 507 aa  272  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  38.27 
 
 		 507 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  38.75 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  39 
 
 		 504 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  38.27 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  39 
 
 		 504 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  39.04 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  39.19 
 
 		 509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  38.32 
 
 		 506 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  38.32 
 
 		 506 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  38.54 
 
 		 507 aa  269  8e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  37.86 
 
 		 606 aa  269  8e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  37.24 
 
 		 513 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  37.91 
 
 		 514 aa  268  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  40.16 
 
 		 506 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  41.91 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  40.17 
 
 		 505 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  39.95 
 
 		 504 aa  263  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0585  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.01 
 
 		 538 aa  261  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  40 
 
 		 517 aa  260  3e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  39.59 
 
 		 502 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  41.94 
 
 		 504 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  38.31 
 
 		 515 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  39.34 
 
 		 504 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  39.34 
 
 		 504 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  37.75 
 
 		 515 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  39.55 
 
 		 511 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  39.55 
 
 		 504 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  39.34 
 
 		 504 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  41.06 
 
 		 515 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  39.49 
 
 		 517 aa  258  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  41 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  42 
 
 		 550 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  42 
 
 		 510 aa  256  4e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  37.96 
 
 		 514 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  38.85 
 
 		 523 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0413  threonine dehydratase  39.02 
 
 		 519 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  38.87 
 
 		 503 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  39.3 
 
 		 529 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 524 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>