More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0585 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0585  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 538 aa  1126    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  38.64 
 
 		 503 aa  312  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  39.88 
 
 		 504 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  37.84 
 
 		 507 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  35.43 
 
 		 514 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  36.01 
 
 		 511 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  35.6 
 
 		 511 aa  303  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  38.16 
 
 		 509 aa  299  1e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  34.36 
 
 		 511 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  36.55 
 
 		 503 aa  296  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  36.16 
 
 		 606 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  35.96 
 
 		 501 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  37.29 
 
 		 509 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  34.42 
 
 		 507 aa  290  6e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  36.25 
 
 		 506 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  36.25 
 
 		 506 aa  288  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  34.3 
 
 		 513 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  35.66 
 
 		 507 aa  287  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  37.08 
 
 		 514 aa  287  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  37.22 
 
 		 506 aa  286  7e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  35.27 
 
 		 504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  34.65 
 
 		 504 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0413  threonine dehydratase  36.81 
 
 		 519 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  37.95 
 
 		 509 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  37.08 
 
 		 503 aa  284  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  36.36 
 
 		 501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  37.87 
 
 		 510 aa  283  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  36.24 
 
 		 526 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0325  threonine dehydratase  36.69 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  39.78 
 
 		 515 aa  282  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0340  threonine dehydratase  35.97 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.432772 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  35.04 
 
 		 507 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0354  threonine dehydratase  35.42 
 
 		 565 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  34.57 
 
 		 507 aa  280  5e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  35.04 
 
 		 507 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  35.23 
 
 		 523 aa  279  9e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0370  threonine dehydratase  36.51 
 
 		 507 aa  279  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  34.84 
 
 		 507 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  36.48 
 
 		 504 aa  276  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  35.8 
 
 		 515 aa  274  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  35.29 
 
 		 517 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1900  threonine dehydratase, biosynthetic  35.33 
 
 		 506 aa  273  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  34.66 
 
 		 516 aa  273  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  35.83 
 
 		 505 aa  273  8.000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  35.34 
 
 		 504 aa  272  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1763  threonine dehydratase, biosynthetic  36.64 
 
 		 512 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  34.92 
 
 		 529 aa  271  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  34.31 
 
 		 527 aa  270  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1605  threonine dehydratase, biosynthetic  35.28 
 
 		 506 aa  270  5.9999999999999995e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.677814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  35.22 
 
 		 517 aa  270  5.9999999999999995e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  38.59 
 
 		 514 aa  269  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  38.12 
 
 		 510 aa  269  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  35.32 
 
 		 502 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  37.58 
 
 		 505 aa  269  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4054  threonine dehydratase  35.61 
 
 		 535 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.536214 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03830  hypothetical threonine dehydratase (Eurofung)  35.85 
 
 		 567 aa  268  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  35.05 
 
 		 503 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  35.39 
 
 		 524 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  36.65 
 
 		 507 aa  267  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  37.92 
 
 		 512 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  38.11 
 
 		 550 aa  266  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  36.15 
 
 		 516 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0840  threonine dehydratase  36.34 
 
 		 507 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0645  threonine dehydratase  35.18 
 
 		 507 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.701109  normal  0.544724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  35.18 
 
 		 524 aa  266  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2392  threonine dehydratase  36.1 
 
 		 507 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0181  threonine dehydratase  36.1 
 
 		 507 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0677  threonine dehydratase  36.1 
 
 		 507 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0662  threonine dehydratase  35.89 
 
 		 507 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2766  threonine dehydratase  36.1 
 
 		 507 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  34.36 
 
 		 515 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2312  threonine dehydratase  36.1 
 
 		 507 aa  265  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1725  threonine dehydratase  36.11 
 
 		 535 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  33.76 
 
 		 511 aa  263  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  34.3 
 
 		 515 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  33.96 
 
 		 504 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  35.04 
 
 		 516 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  34.09 
 
 		 549 aa  263  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  33.83 
 
 		 531 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0284  threonine dehydratase  35.97 
 
 		 535 aa  262  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  35.03 
 
 		 515 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  35.5 
 
 		 507 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  37.01 
 
 		 424 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2787  threonine dehydratase  35.88 
 
 		 507 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1144  threonine dehydratase  35.1 
 
 		 535 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15844  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1809  threonine dehydratase  35.33 
 
 		 535 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  35.13 
 
 		 504 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  35.13 
 
 		 504 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  34.36 
 
 		 510 aa  259  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  35.82 
 
 		 517 aa  259  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2654  threonine dehydratase  35.04 
 
 		 507 aa  259  8e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  34.91 
 
 		 504 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  35.96 
 
 		 505 aa  259  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0365  threonine dehydratase  34.75 
 
 		 557 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3661  threonine dehydratase  34.75 
 
 		 557 aa  259  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0087  threonine dehydratase  37.08 
 
 		 504 aa  259  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  33.76 
 
 		 504 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  35.31 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  34.91 
 
 		 504 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09511  threonine dehydratase  33.54 
 
 		 513 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.350493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>