More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0204 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  100 
 
 
416 aa  847    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  55.16 
 
 
422 aa  479  1e-134  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  54.81 
 
 
422 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  54.81 
 
 
422 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  54.46 
 
 
420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  54.46 
 
 
420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  54.46 
 
 
420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  54.46 
 
 
420 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  54.83 
 
 
420 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  54.22 
 
 
420 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  54.22 
 
 
420 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  54.22 
 
 
420 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  54.5 
 
 
412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  53.73 
 
 
420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  53.73 
 
 
420 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  53.98 
 
 
421 aa  448  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  49.88 
 
 
423 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  50.12 
 
 
423 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  47.57 
 
 
424 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  50.86 
 
 
414 aa  415  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  49.88 
 
 
415 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  49.15 
 
 
418 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  45.89 
 
 
437 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  48.43 
 
 
417 aa  408  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  45.67 
 
 
414 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  45.93 
 
 
426 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  45.93 
 
 
426 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  45.93 
 
 
426 aa  368  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  47.22 
 
 
429 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  48.48 
 
 
429 aa  363  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  43.96 
 
 
413 aa  355  5.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  44.28 
 
 
420 aa  355  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  42.41 
 
 
415 aa  342  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  41.43 
 
 
416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  43.07 
 
 
415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  46.81 
 
 
431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  47.98 
 
 
429 aa  330  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  39.71 
 
 
416 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  42.29 
 
 
437 aa  325  7e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  45.54 
 
 
423 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  39.71 
 
 
416 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  43.14 
 
 
408 aa  322  5e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  38.93 
 
 
418 aa  318  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  42.29 
 
 
457 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  42.51 
 
 
412 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  42.12 
 
 
404 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  43.46 
 
 
425 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  42.44 
 
 
439 aa  310  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  43.91 
 
 
408 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  39.28 
 
 
415 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  40.05 
 
 
509 aa  280  5e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  38.38 
 
 
506 aa  266  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  38.38 
 
 
506 aa  266  5e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  37.69 
 
 
501 aa  266  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  37.78 
 
 
514 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  39.39 
 
 
516 aa  265  8e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  37.72 
 
 
606 aa  264  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  39.14 
 
 
503 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  38.29 
 
 
511 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  37.41 
 
 
507 aa  263  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  38.79 
 
 
511 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  40.11 
 
 
402 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  39.66 
 
 
509 aa  259  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  34.66 
 
 
513 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  38.26 
 
 
511 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  39.67 
 
 
400 aa  258  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  42.82 
 
 
504 aa  257  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  37.37 
 
 
526 aa  257  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  39.94 
 
 
405 aa  255  9e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  37.63 
 
 
514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  39.39 
 
 
509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  36.57 
 
 
514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  40.11 
 
 
403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  37.78 
 
 
504 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  38.19 
 
 
504 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  37.28 
 
 
507 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  39.28 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  38.93 
 
 
520 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  39.02 
 
 
517 aa  252  7e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  38.76 
 
 
517 aa  252  9.000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  37.8 
 
 
501 aa  252  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  38.29 
 
 
515 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  35.35 
 
 
507 aa  249  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  36.87 
 
 
503 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  38.04 
 
 
515 aa  249  6e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  41.08 
 
 
402 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  35.84 
 
 
515 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  39.44 
 
 
511 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  40.25 
 
 
505 aa  247  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  39.52 
 
 
531 aa  247  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  36.87 
 
 
505 aa  246  6.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  38.54 
 
 
523 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  35.25 
 
 
527 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  36.83 
 
 
403 aa  244  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  35.5 
 
 
549 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  37.35 
 
 
510 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  39.48 
 
 
403 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  39.04 
 
 
516 aa  241  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0183  threonine dehydratase  38.87 
 
 
511 aa  240  4e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  37.15 
 
 
529 aa  239  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>