More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2496 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  100 
 
 		 416 aa  843    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  75.48 
 
 		 416 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  75 
 
 		 416 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  73.67 
 
 		 415 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  64.48 
 
 		 418 aa  540  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  66.09 
 
 		 404 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  64.59 
 
 		 408 aa  510  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  60.53 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  62.99 
 
 		 413 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  61.19 
 
 		 415 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  61.41 
 
 		 412 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  57 
 
 		 408 aa  448  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  59.16 
 
 		 425 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  46.1 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  45.37 
 
 		 437 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  47.41 
 
 		 418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  46.06 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  47.41 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  47.41 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  47.41 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  46.84 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  44.25 
 
 		 423 aa  339  5e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  42.52 
 
 		 422 aa  338  9e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  47.18 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  41.43 
 
 		 416 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  44.01 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  43.03 
 
 		 420 aa  332  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  42.54 
 
 		 412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  42.11 
 
 		 420 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  42.3 
 
 		 420 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  43.48 
 
 		 422 aa  325  7e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  43.48 
 
 		 422 aa  325  7e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  42.54 
 
 		 420 aa  325  9e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  42.61 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  42.3 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  42.62 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  42.05 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  43.14 
 
 		 420 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  45.82 
 
 		 429 aa  315  6e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  42.03 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  48.45 
 
 		 429 aa  300  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  44.19 
 
 		 420 aa  298  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  38.76 
 
 		 421 aa  295  8e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  41.57 
 
 		 439 aa  280  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  40.62 
 
 		 457 aa  269  8e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  42.75 
 
 		 431 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  40.62 
 
 		 437 aa  266  5e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  34.76 
 
 		 503 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  36.79 
 
 		 511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  36.52 
 
 		 503 aa  230  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  35.43 
 
 		 509 aa  228  1e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  36.02 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  35.59 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  35.59 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  34.6 
 
 		 513 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  35.77 
 
 		 507 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  35.46 
 
 		 514 aa  223  6e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  37.44 
 
 		 504 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  35.93 
 
 		 514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  37.44 
 
 		 504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  35.41 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  38.04 
 
 		 501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  33.92 
 
 		 514 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  38.56 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  37 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  35.95 
 
 		 509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  37.59 
 
 		 522 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  34.26 
 
 		 507 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  34.26 
 
 		 507 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  36.68 
 
 		 515 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  34.01 
 
 		 507 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  33.58 
 
 		 526 aa  216  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  36.43 
 
 		 509 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  32.75 
 
 		 511 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  33.58 
 
 		 606 aa  214  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  36.07 
 
 		 523 aa  213  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  32.49 
 
 		 511 aa  212  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  32.33 
 
 		 507 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  34.69 
 
 		 516 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  33.75 
 
 		 507 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  36.18 
 
 		 504 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  34.6 
 
 		 502 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  33.17 
 
 		 501 aa  209  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  35.91 
 
 		 519 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  35.66 
 
 		 530 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  36.14 
 
 		 504 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  32.93 
 
 		 517 aa  206  4e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  34.09 
 
 		 503 aa  207  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  36.14 
 
 		 504 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  36.14 
 
 		 504 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  36.14 
 
 		 511 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  36.14 
 
 		 504 aa  206  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  35.56 
 
 		 510 aa  206  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  33.66 
 
 		 507 aa  205  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  31.73 
 
 		 517 aa  205  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  36.09 
 
 		 504 aa  205  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  35.18 
 
 		 519 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>