More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2649 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  100 
 
 		 415 aa  842    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  91.81 
 
 		 415 aa  749    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  73.25 
 
 		 412 aa  582  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  69.16 
 
 		 413 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  68.43 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  65.78 
 
 		 408 aa  533  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  62.14 
 
 		 416 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  61.89 
 
 		 416 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  60.53 
 
 		 416 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  59.33 
 
 		 418 aa  488  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  59.16 
 
 		 404 aa  481  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  61.5 
 
 		 415 aa  475  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  59.85 
 
 		 408 aa  464  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  46.36 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  46.47 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  46.8 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  46.79 
 
 		 414 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  44.82 
 
 		 423 aa  358  7e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  46.44 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  44.99 
 
 		 420 aa  353  4e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  43.84 
 
 		 420 aa  349  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  45.57 
 
 		 415 aa  349  4e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  45.12 
 
 		 418 aa  349  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  44.09 
 
 		 420 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  43.84 
 
 		 420 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  44.09 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  44.09 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  43.84 
 
 		 420 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  43.84 
 
 		 420 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  43.84 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  43.6 
 
 		 420 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  43.6 
 
 		 412 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  42.41 
 
 		 416 aa  342  8e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  43.26 
 
 		 422 aa  341  1e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  43 
 
 		 414 aa  335  7.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  44.82 
 
 		 422 aa  332  5e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  44.82 
 
 		 422 aa  332  5e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  48.23 
 
 		 420 aa  322  7e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  45.96 
 
 		 429 aa  322  7e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  43.83 
 
 		 426 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  43.83 
 
 		 426 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  43.83 
 
 		 426 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  45.34 
 
 		 429 aa  299  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  45.8 
 
 		 423 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  41.33 
 
 		 421 aa  288  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  43.45 
 
 		 457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  46.27 
 
 		 439 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  46.7 
 
 		 429 aa  276  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  41.75 
 
 		 437 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  43.31 
 
 		 431 aa  259  6e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  38.73 
 
 		 514 aa  249  6e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  37.56 
 
 		 506 aa  247  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  38.69 
 
 		 520 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  37.56 
 
 		 506 aa  247  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  35.19 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  37.31 
 
 		 507 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  36.07 
 
 		 503 aa  237  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  35.61 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  35.95 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  33.76 
 
 		 514 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  36.55 
 
 		 501 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  36.07 
 
 		 505 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  36.71 
 
 		 509 aa  233  5e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  36.91 
 
 		 504 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  35.31 
 
 		 507 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  36.91 
 
 		 504 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  35.14 
 
 		 517 aa  232  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  37.5 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  32.49 
 
 		 511 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1820  threonine dehydratase, biosynthetic  38.8 
 
 		 505 aa  230  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  38.18 
 
 		 531 aa  229  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  32.49 
 
 		 511 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  34.59 
 
 		 511 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  39.55 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  35.56 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  34.75 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  34.32 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  34.57 
 
 		 507 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  36.96 
 
 		 515 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  38.32 
 
 		 515 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  38.21 
 
 		 523 aa  225  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  34.09 
 
 		 507 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  37.06 
 
 		 545 aa  224  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  37.1 
 
 		 504 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  38.25 
 
 		 519 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  37.32 
 
 		 504 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  37.22 
 
 		 504 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  37.32 
 
 		 504 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  34.77 
 
 		 503 aa  222  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0365  threonine dehydratase  37.56 
 
 		 557 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3661  threonine dehydratase  37.56 
 
 		 557 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  37.22 
 
 		 504 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  37.19 
 
 		 505 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  35.91 
 
 		 504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  34.52 
 
 		 514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  37.69 
 
 		 519 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  37.44 
 
 		 530 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0627  threonine dehydratase, biosynthetic  39.32 
 
 		 509 aa  219  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.554958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  36.75 
 
 		 504 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4909  threonine dehydratase  36 
 
 		 527 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>