More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3634 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  91.14 
 
 
429 aa  786    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  82.01 
 
 
426 aa  712    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  100 
 
 
429 aa  867    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  82.01 
 
 
429 aa  636    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  82.01 
 
 
426 aa  712    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  82.01 
 
 
426 aa  712    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  64.09 
 
 
420 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  65.64 
 
 
439 aa  498  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  58.42 
 
 
457 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  57.18 
 
 
437 aa  443  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  58.5 
 
 
431 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  54.96 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  48.03 
 
 
424 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  48.48 
 
 
416 aa  384  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  50.77 
 
 
423 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  49.49 
 
 
423 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  46.78 
 
 
437 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  45.25 
 
 
422 aa  373  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  48.08 
 
 
414 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  45.3 
 
 
417 aa  374  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  47.12 
 
 
418 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  47.52 
 
 
420 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  47.52 
 
 
420 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  47.03 
 
 
420 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  47.28 
 
 
420 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  49.61 
 
 
415 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  47.03 
 
 
420 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  47.03 
 
 
412 aa  358  8e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  47.03 
 
 
420 aa  358  8e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  47.03 
 
 
420 aa  358  8e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  47.03 
 
 
420 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  47.03 
 
 
420 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  46.78 
 
 
420 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  44.25 
 
 
422 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  44.25 
 
 
422 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  43.9 
 
 
414 aa  344  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  45.82 
 
 
416 aa  336  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  44.58 
 
 
421 aa  327  3e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  45.34 
 
 
415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  46.21 
 
 
413 aa  320  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  46.49 
 
 
415 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  42.93 
 
 
416 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  46.56 
 
 
412 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  43.07 
 
 
416 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  44.82 
 
 
404 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  44.67 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  44.78 
 
 
418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  47.38 
 
 
425 aa  294  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  45.5 
 
 
408 aa  293  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  44.33 
 
 
415 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  38.5 
 
 
501 aa  240  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  40.62 
 
 
509 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  36.56 
 
 
511 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  37.15 
 
 
507 aa  229  7e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  38.83 
 
 
504 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  38.83 
 
 
504 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  36.84 
 
 
507 aa  226  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  37.57 
 
 
516 aa  225  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  39.27 
 
 
517 aa  223  6e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  38.48 
 
 
526 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  37.47 
 
 
520 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  38.98 
 
 
517 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  34.18 
 
 
511 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  35.05 
 
 
514 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  39.15 
 
 
606 aa  219  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  37.05 
 
 
506 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  37.05 
 
 
506 aa  218  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  37.41 
 
 
514 aa  218  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  36.32 
 
 
531 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  35.31 
 
 
509 aa  216  5e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  35.79 
 
 
507 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  33.93 
 
 
511 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  39.79 
 
 
504 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  33.07 
 
 
513 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  39.79 
 
 
504 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  39.52 
 
 
504 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  38.59 
 
 
515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  38.59 
 
 
515 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  38.83 
 
 
504 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  37.4 
 
 
522 aa  213  7.999999999999999e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  37.2 
 
 
504 aa  212  9e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3806  threonine dehydratase, biosynthetic  39.36 
 
 
507 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.276753  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5288  threonine dehydratase, biosynthetic  39.36 
 
 
514 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  37.13 
 
 
501 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  37.82 
 
 
515 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1672  threonine dehydratase  39.1 
 
 
511 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4846  threonine dehydratase  39.1 
 
 
504 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  36.69 
 
 
405 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  39.5 
 
 
529 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  38.3 
 
 
504 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  34.63 
 
 
403 aa  209  5e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  34.81 
 
 
503 aa  209  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  36.87 
 
 
510 aa  209  9e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  35.82 
 
 
514 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  34.56 
 
 
403 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  37.5 
 
 
504 aa  206  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  33.24 
 
 
408 aa  206  5e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  37.43 
 
 
523 aa  206  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  37.21 
 
 
505 aa  206  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  37.01 
 
 
505 aa  206  9e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>