More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11591 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  83.22 
 
 
426 aa  721    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11591  threonine dehydratase  100 
 
 
429 aa  857    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.032479999999999e-51  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3634  threonine dehydratase  82.01 
 
 
429 aa  691    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  83.22 
 
 
426 aa  721    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  83.22 
 
 
426 aa  721    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  83.18 
 
 
429 aa  708    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1991  threonine dehydratase  66.98 
 
 
439 aa  504  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.845373  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  64.89 
 
 
420 aa  495  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2990  threonine dehydratase  59.43 
 
 
457 aa  497  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3353  threonine dehydratase  61.74 
 
 
431 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0223363  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09210  threonine dehydratase  57.28 
 
 
437 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23350  threonine dehydratase  57.59 
 
 
423 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324604  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5911  threonine dehydratase  48.18 
 
 
424 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1924  threonine dehydratase  49.41 
 
 
418 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14942  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1584  threonine dehydratase  49.51 
 
 
423 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000192202  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  47.79 
 
 
437 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2586  threonine dehydratase  52.05 
 
 
423 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  47.32 
 
 
417 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1447  threonine dehydratase  49.25 
 
 
420 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.102012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3487  threonine dehydratase  46.83 
 
 
420 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3429  threonine dehydratase  48.8 
 
 
414 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  47.5 
 
 
416 aa  374  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  45.54 
 
 
422 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1892  threonine dehydratase  46.59 
 
 
420 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1003  threonine dehydratase  50.13 
 
 
415 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000180707  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1711  threonine dehydratase  47.07 
 
 
420 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1855  threonine dehydratase  46.34 
 
 
420 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1718  threonine dehydratase  46.59 
 
 
420 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1695  threonine dehydratase  46.34 
 
 
420 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1670  threonine dehydratase  46.34 
 
 
420 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1854  threonine dehydratase  46.59 
 
 
420 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1938  threonine dehydratase  46.1 
 
 
412 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1970  threonine dehydratase  46.1 
 
 
420 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1906  threonine dehydratase  42.01 
 
 
414 aa  351  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2135  threonine dehydratase  45.02 
 
 
422 aa  346  5e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098  threonine dehydratase  45.02 
 
 
422 aa  346  5e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  48.45 
 
 
416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1956  threonine dehydratase  46.25 
 
 
421 aa  342  7e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2649  threonine dehydratase  46.52 
 
 
415 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.384184  normal  0.666765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  44.09 
 
 
416 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2872  threonine dehydratase  48.4 
 
 
415 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1421  threonine dehydratase  43.78 
 
 
416 aa  320  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  46.27 
 
 
413 aa  311  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0497  threonine dehydratase  46.73 
 
 
412 aa  309  5.9999999999999995e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1051  threonine dehydratase  44.81 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2138  threonine dehydratase  43.83 
 
 
404 aa  302  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134573  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1421  threonine dehydratase  45.26 
 
 
418 aa  298  8e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1373  threonine dehydratase  44.89 
 
 
415 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  44.88 
 
 
408 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0069  threonine dehydratase  46.01 
 
 
425 aa  280  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  40.64 
 
 
501 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0449  threonine dehydratase  39.21 
 
 
507 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  37.8 
 
 
511 aa  242  7.999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  39.79 
 
 
506 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  39.79 
 
 
506 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  39.64 
 
 
504 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  39.64 
 
 
504 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3647  threonine dehydratase  40.16 
 
 
516 aa  239  9e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  37.76 
 
 
507 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  42.12 
 
 
514 aa  237  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  38.76 
 
 
509 aa  236  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  36.83 
 
 
514 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  41.4 
 
 
509 aa  236  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  36.1 
 
 
511 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  36.1 
 
 
511 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  35.31 
 
 
513 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  40.06 
 
 
517 aa  229  8e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  38.46 
 
 
522 aa  229  9e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  39.78 
 
 
515 aa  229  9e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  39.59 
 
 
606 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0585  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.25 
 
 
538 aa  228  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  39.78 
 
 
517 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3125  L-threonine ammonia-lyase  38.46 
 
 
526 aa  227  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00487268  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  41.22 
 
 
504 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  38.54 
 
 
507 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  38.27 
 
 
507 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  40.44 
 
 
515 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  40.44 
 
 
515 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  38.54 
 
 
507 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  37.53 
 
 
507 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  38.54 
 
 
507 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  38.69 
 
 
531 aa  223  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  40.81 
 
 
504 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15381  threonine dehydratase  38.14 
 
 
514 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.313826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  40.56 
 
 
529 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  40.43 
 
 
504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  38.54 
 
 
509 aa  220  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0183  threonine dehydratase  37.05 
 
 
511 aa  221  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  40.43 
 
 
504 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  40.16 
 
 
504 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.167113 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  36.97 
 
 
402 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  40.16 
 
 
504 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  40.43 
 
 
545 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  39.84 
 
 
505 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  38.95 
 
 
520 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0284  threonine dehydratase  39.79 
 
 
535 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  35.56 
 
 
549 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1809  threonine dehydratase  39.52 
 
 
535 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  39.38 
 
 
504 aa  216  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  38.22 
 
 
523 aa  216  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>