More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31740 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_31740  predicted protein  100 
 
 
468 aa  946    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.414163 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19518  predicted protein  52.64 
 
 
479 aa  365  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  50 
 
 
404 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  43.73 
 
 
403 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  44.01 
 
 
403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  44.08 
 
 
403 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  42.98 
 
 
405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  44.01 
 
 
403 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  43.7 
 
 
402 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  39.42 
 
 
403 aa  270  4e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  42.27 
 
 
400 aa  270  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  39.85 
 
 
403 aa  268  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  40.75 
 
 
400 aa  267  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  39.32 
 
 
399 aa  262  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  42.58 
 
 
402 aa  259  7e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  37.09 
 
 
400 aa  258  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  36.86 
 
 
403 aa  257  4e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  42.74 
 
 
418 aa  256  6e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  37.33 
 
 
403 aa  256  7e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  42.36 
 
 
415 aa  254  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  37.19 
 
 
403 aa  252  8.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  38.68 
 
 
401 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  41.5 
 
 
401 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  41.5 
 
 
401 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  36.75 
 
 
398 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  35.82 
 
 
403 aa  250  4e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  35.82 
 
 
403 aa  249  6e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  41.03 
 
 
409 aa  249  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  36.84 
 
 
403 aa  249  8e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  41.55 
 
 
402 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  42.15 
 
 
415 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  40.65 
 
 
412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  37.54 
 
 
403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  39.11 
 
 
395 aa  246  9e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  34.92 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  40.25 
 
 
413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  37.13 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  40 
 
 
398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  42.31 
 
 
402 aa  243  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  40.41 
 
 
421 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  36.93 
 
 
401 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  39.27 
 
 
404 aa  241  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  34.67 
 
 
402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  40.49 
 
 
416 aa  240  4e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  40.62 
 
 
416 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  41.67 
 
 
402 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  34.24 
 
 
403 aa  237  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  40.1 
 
 
415 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  38.73 
 
 
415 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  38.68 
 
 
402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  38.93 
 
 
403 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  40.94 
 
 
407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  39.39 
 
 
408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  44.19 
 
 
404 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  39.75 
 
 
412 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  39.29 
 
 
410 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  40.92 
 
 
411 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  38.12 
 
 
408 aa  231  2e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  38.52 
 
 
402 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4294  threonine dehydratase  39.33 
 
 
425 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6836  threonine dehydratase  37.91 
 
 
413 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211466  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  35.95 
 
 
415 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  41.37 
 
 
410 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  36.78 
 
 
399 aa  227  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  36.78 
 
 
399 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  39.06 
 
 
402 aa  225  1e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  35.7 
 
 
403 aa  224  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  37.28 
 
 
415 aa  223  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  39.8 
 
 
421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  41.11 
 
 
402 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  39.06 
 
 
406 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  38.73 
 
 
410 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  40.73 
 
 
404 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  33.74 
 
 
406 aa  217  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7574  threonine dehydratase  38.32 
 
 
415 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  35.86 
 
 
537 aa  216  8e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  35.88 
 
 
501 aa  216  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  38.38 
 
 
410 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  38.48 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  40.83 
 
 
402 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  40.28 
 
 
402 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  39.07 
 
 
403 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  39.59 
 
 
410 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  38.18 
 
 
414 aa  211  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  40.27 
 
 
401 aa  211  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  39.61 
 
 
402 aa  209  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  37.03 
 
 
408 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  38.8 
 
 
403 aa  207  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  39.54 
 
 
400 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  34.83 
 
 
514 aa  206  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  38.5 
 
 
406 aa  206  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  35.68 
 
 
411 aa  206  9e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.43 
 
 
320 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  37.71 
 
 
403 aa  204  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  39.07 
 
 
404 aa  204  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  37.44 
 
 
422 aa  203  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0204  threonine dehydratase  35.06 
 
 
416 aa  203  5e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.123725  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  43.35 
 
 
358 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  35.68 
 
 
403 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  40.44 
 
 
411 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>