More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1533 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  81.2 
 
 		 403 aa  649    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1533  threonine dehydratase  100 
 
 		 402 aa  803    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.331802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  82.75 
 
 		 403 aa  651    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1029  threonine dehydratase  84.75 
 
 		 402 aa  628  1e-179  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010709 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  56.25 
 
 		 418 aa  431  1e-119  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  51.99 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  43.44 
 
 		 405 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  44.42 
 
 		 403 aa  334  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  48.13 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  43.2 
 
 		 402 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  43.2 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  49.86 
 
 		 403 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  42.93 
 
 		 403 aa  306  6e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  48.41 
 
 		 403 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  48.85 
 
 		 403 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  41.04 
 
 		 402 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  39.02 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  45.84 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  47.66 
 
 		 414 aa  294  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  44.85 
 
 		 411 aa  293  5e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  45.97 
 
 		 402 aa  292  7e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.22 
 
 		 343 aa  289  5.0000000000000004e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  41.73 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  45 
 
 		 408 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  47.37 
 
 		 401 aa  286  5e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  47.37 
 
 		 401 aa  286  5e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  39.33 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  45.95 
 
 		 403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  40.76 
 
 		 402 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  41.25 
 
 		 403 aa  283  5.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  39.07 
 
 		 403 aa  282  7.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  40.68 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  39.07 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  42.71 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  46.21 
 
 		 404 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  41.71 
 
 		 402 aa  273  3e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  42.02 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  39.58 
 
 		 403 aa  271  2e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  43.91 
 
 		 403 aa  269  5e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  39.95 
 
 		 406 aa  269  5e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  45.78 
 
 		 410 aa  268  8.999999999999999e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  43.3 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  46.63 
 
 		 411 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  43.23 
 
 		 415 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  46.42 
 
 		 402 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  43.77 
 
 		 402 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  45.27 
 
 		 416 aa  264  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  46.91 
 
 		 413 aa  262  6e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  39.89 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  44.44 
 
 		 402 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  44.44 
 
 		 405 aa  259  9e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  44.27 
 
 		 410 aa  256  6e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  49.19 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  46.55 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  42.67 
 
 		 403 aa  254  3e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  42.86 
 
 		 406 aa  254  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  45.58 
 
 		 402 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  42.6 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  45.95 
 
 		 402 aa  248  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  42.65 
 
 		 415 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  42.78 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  42.67 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  45.66 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  39.9 
 
 		 421 aa  246  4e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  37.73 
 
 		 409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  40.17 
 
 		 402 aa  246  6e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  43.83 
 
 		 412 aa  245  8e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  44.38 
 
 		 537 aa  245  8e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  42.32 
 
 		 398 aa  245  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  38.4 
 
 		 399 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2664  threonine dehydratase  42.11 
 
 		 415 aa  243  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  41.73 
 
 		 406 aa  242  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  40.69 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  42.38 
 
 		 415 aa  242  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  38.46 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  38.3 
 
 		 412 aa  240  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  42.93 
 
 		 401 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0909  threonine dehydratase  44.8 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2877  threonine dehydratase  42.74 
 
 		 422 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188993  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  43.35 
 
 		 416 aa  237  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  38.38 
 
 		 400 aa  236  7e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0289  threonine dehydratase  42.31 
 
 		 442 aa  235  8e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.122969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  44.82 
 
 		 410 aa  236  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  37.11 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 412 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  43.26 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  40.15 
 
 		 412 aa  229  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  40.05 
 
 		 412 aa  229  9e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  45.16 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1527  threonine dehydratase  45.98 
 
 		 346 aa  226  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0934976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1498  threonine dehydratase  45.98 
 
 		 346 aa  226  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2394  threonine dehydratase  43.15 
 
 		 415 aa  226  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1100  threonine dehydratase  42 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  41.27 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  38.68 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  39.45 
 
 		 411 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  39.32 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  41.69 
 
 		 400 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  38.38 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>