More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0316 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0316  diaminopropionate ammonia-lyase  100 
 
 		 402 aa  776    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  64.9 
 
 		 397 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  65.74 
 
 		 403 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5076  diaminopropionate ammonia-lyase  65.99 
 
 		 399 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0463571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4781  diaminopropionate ammonia-lyase  64.47 
 
 		 403 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1864  diaminopropionate ammonia-lyase  59.65 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0500959  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0159  diaminopropionate ammonia-lyase  51.38 
 
 		 410 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  50.13 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  52.31 
 
 		 410 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  49.35 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  50.57 
 
 		 401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  47.46 
 
 		 415 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  46.15 
 
 		 396 aa  290  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  44.63 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  47.15 
 
 		 414 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1266  diaminopropionate ammonia-lyase  41.15 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  46.9 
 
 		 414 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4600  diaminopropionate ammonia-lyase  48.23 
 
 		 410 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5230  diaminopropionate ammonia-lyase  47.09 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5629  diaminopropionate ammonia-lyase  47.09 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00139675 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0259  diaminopropionate ammonia-lyase  37.2 
 
 		 400 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  35.96 
 
 		 406 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.16044  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0057  diaminopropionate ammonia-lyase  46.08 
 
 		 410 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  37.33 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  36.94 
 
 		 400 aa  249  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4080  diaminopropionate ammonia-lyase  37.2 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0105  diaminopropionate ammonia-lyase  36.94 
 
 		 393 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02704  diaminopropionate ammonia-lyase  37.6 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3031  diaminopropionate ammonia-lyase  37.6 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0837  diaminopropionate ammonia-lyase  37.6 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02666  hypothetical protein  37.6 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  37.6 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  37.6 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3004  diaminopropionate ammonia-lyase  37.6 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3196  diaminopropionate ammonia-lyase  37.6 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1434  diaminopropionate ammonia-lyase  36.96 
 
 		 413 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0421  diaminopropionate ammonia-lyase  41.01 
 
 		 410 aa  243  5e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  37.16 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  37.63 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1038  diaminopropionate ammonia-lyase  35.28 
 
 		 404 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  hitchhiker  0.00023872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1103  diaminopropionate ammonia-lyase  35.28 
 
 		 404 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1070  diaminopropionate ammonia-lyase  35.28 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1011  diaminopropionate ammonia-lyase  35.28 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000144159  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6425  diaminopropionate ammonia-lyase  38.87 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3023  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.01 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  39.34 
 
 		 397 aa  229  7e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6137  diaminopropionate ammonia-lyase  38.59 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  36.21 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0639  diaminopropionate ammonia-lyase  32.88 
 
 		 410 aa  219  8.999999999999998e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  38.18 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3336  diaminopropionate ammonia-lyase  47.73 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0394845  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1635  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.56 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.752486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1828  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.32 
 
 		 345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2709  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.26 
 
 		 352 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.879524 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  34.83 
 
 		 753 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3533  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.1 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1343  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.46 
 
 		 368 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  30.06 
 
 		 514 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  33.66 
 
 		 318 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  33.19 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1733  hypothetical protein  37.38 
 
 		 116 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000606559  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  32.77 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  24.52 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  26.57 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  24.26 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  28.66 
 
 		 510 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  26.12 
 
 		 332 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  33.19 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  31.93 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  33.19 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  25.2 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  31.93 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  29.02 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  32.32 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  30.18 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  26.89 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4633  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.15 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  27.24 
 
 		 515 aa  59.7  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  28.85 
 
 		 506 aa  60.1  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  33.57 
 
 		 527 aa  59.7  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  34.39 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  30.1 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1083  threonine dehydratase  28.89 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.715043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  32.26 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.6 
 
 		 333 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  24.68 
 
 		 501 aa  57  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  25.3 
 
 		 511 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  28.67 
 
 		 503 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  30.55 
 
 		 512 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  27.17 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  27.37 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0299  threonine dehydratase  25.3 
 
 		 511 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.380007  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  24.91 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3032  threonine dehydratase, biosynthetic  30.55 
 
 		 550 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.08767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  27.37 
 
 		 504 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  29.05 
 
 		 549 aa  55.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  28.05 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0730  hypothetical protein  30.21 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0901199  normal  0.986029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  27.11 
 
 		 505 aa  54.3  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3256  threonine dehydratase, biosynthetic  30.55 
 
 		 510 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.786977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>