More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5230 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0057  diaminopropionate ammonia-lyase  93.41 
 
 		 410 aa  713    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5230  diaminopropionate ammonia-lyase  100 
 
 		 410 aa  813    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  84.3 
 
 		 414 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  85.02 
 
 		 414 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4600  diaminopropionate ammonia-lyase  98.05 
 
 		 410 aa  798    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175308 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5629  diaminopropionate ammonia-lyase  100 
 
 		 410 aa  813    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00139675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  68.01 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  65.92 
 
 		 401 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  47.95 
 
 		 410 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  43.85 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  45.36 
 
 		 407 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  44.76 
 
 		 396 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  47.39 
 
 		 410 aa  301  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  46.12 
 
 		 397 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0159  diaminopropionate ammonia-lyase  47.01 
 
 		 410 aa  295  8e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0316  diaminopropionate ammonia-lyase  47.09 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5076  diaminopropionate ammonia-lyase  41.48 
 
 		 399 aa  276  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0463571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  44.11 
 
 		 403 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6137  diaminopropionate ammonia-lyase  42.23 
 
 		 408 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6425  diaminopropionate ammonia-lyase  42.23 
 
 		 408 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4781  diaminopropionate ammonia-lyase  42.49 
 
 		 403 aa  246  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1864  diaminopropionate ammonia-lyase  45.3 
 
 		 399 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0500959  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1038  diaminopropionate ammonia-lyase  40.06 
 
 		 404 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  hitchhiker  0.00023872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1070  diaminopropionate ammonia-lyase  40.06 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1103  diaminopropionate ammonia-lyase  39.78 
 
 		 404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1011  diaminopropionate ammonia-lyase  39.78 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000144159  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02704  diaminopropionate ammonia-lyase  39.73 
 
 		 398 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02666  hypothetical protein  39.73 
 
 		 398 aa  233  6e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3031  diaminopropionate ammonia-lyase  39.73 
 
 		 398 aa  233  6e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0837  diaminopropionate ammonia-lyase  39.73 
 
 		 398 aa  233  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  39.73 
 
 		 398 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  39.73 
 
 		 398 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3196  diaminopropionate ammonia-lyase  39.73 
 
 		 398 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3004  diaminopropionate ammonia-lyase  39.73 
 
 		 398 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  37.5 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  35.9 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.16044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1266  diaminopropionate ammonia-lyase  40.56 
 
 		 406 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0259  diaminopropionate ammonia-lyase  37.23 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167418  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  40.4 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0639  diaminopropionate ammonia-lyase  36.93 
 
 		 410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0105  diaminopropionate ammonia-lyase  37.68 
 
 		 393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4080  diaminopropionate ammonia-lyase  37.89 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1434  diaminopropionate ammonia-lyase  36.44 
 
 		 413 aa  216  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  37.47 
 
 		 397 aa  215  9e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  36.94 
 
 		 408 aa  211  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  37.47 
 
 		 390 aa  208  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  36.54 
 
 		 405 aa  206  5e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0421  diaminopropionate ammonia-lyase  38.95 
 
 		 410 aa  202  7e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1635  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.86 
 
 		 402 aa  186  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.752486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3023  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.39 
 
 		 396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  33.97 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3336  diaminopropionate ammonia-lyase  43.37 
 
 		 380 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0394845  normal  0.212705 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  33.43 
 
 		 753 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1343  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  46.36 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3533  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.42 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2709  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.5 
 
 		 352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1828  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.12 
 
 		 345 aa  126  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  29.35 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  24.79 
 
 		 507 aa  77  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  27.52 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  26.56 
 
 		 503 aa  77  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  26.64 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  31.6 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  26.34 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  28.62 
 
 		 514 aa  73.6  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3226  hypothetical protein  31.1 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  26.55 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  30.86 
 
 		 515 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  26.25 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  32.63 
 
 		 506 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  32.63 
 
 		 506 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  29.35 
 
 		 504 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  29.35 
 
 		 504 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  27.36 
 
 		 509 aa  69.7  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4245  hypothetical protein  28.15 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  27.7 
 
 		 505 aa  68.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  25.89 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  30.77 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2225  hypothetical protein  31.11 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000104574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3855  hypothetical protein  28.37 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  26.62 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  30.55 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6086  hypothetical protein  29.08 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  30.55 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.6 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  24.92 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  23.79 
 
 		 514 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  26.56 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  26.75 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  27.59 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3749  hypothetical protein  29.54 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.38 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1673  threonine dehydratase  22.67 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  27.73 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  26.77 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  27.04 
 
 		 502 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0819  hypothetical protein  28.62 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  29.55 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  30.48 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4441  hypothetical protein  28.18 
 
 		 339 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>