More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3336 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3336  diaminopropionate ammonia-lyase  100 
 
 		 380 aa  726    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0394845  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3023  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  50 
 
 		 396 aa  326  5e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1635  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  48.19 
 
 		 402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.752486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  42.93 
 
 		 410 aa  256  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5076  diaminopropionate ammonia-lyase  44.32 
 
 		 399 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0463571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  37.84 
 
 		 405 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  37.13 
 
 		 406 aa  239  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.16044  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0316  diaminopropionate ammonia-lyase  48.02 
 
 		 402 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  41.64 
 
 		 753 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  38.5 
 
 		 397 aa  236  6e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4080  diaminopropionate ammonia-lyase  38.17 
 
 		 392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0105  diaminopropionate ammonia-lyase  37.63 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  39.51 
 
 		 408 aa  232  7.000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1266  diaminopropionate ammonia-lyase  39.73 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1103  diaminopropionate ammonia-lyase  36.6 
 
 		 404 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1011  diaminopropionate ammonia-lyase  36.6 
 
 		 404 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000144159  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1038  diaminopropionate ammonia-lyase  36.6 
 
 		 404 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  hitchhiker  0.00023872 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  45.38 
 
 		 403 aa  229  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  45.53 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1070  diaminopropionate ammonia-lyase  36.34 
 
 		 404 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973165 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  38.25 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0421  diaminopropionate ammonia-lyase  39.95 
 
 		 410 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  37.84 
 
 		 400 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0259  diaminopropionate ammonia-lyase  38.3 
 
 		 400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  42.74 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  37.53 
 
 		 398 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3196  diaminopropionate ammonia-lyase  37.53 
 
 		 398 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3004  diaminopropionate ammonia-lyase  37.53 
 
 		 398 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  37.53 
 
 		 398 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02704  diaminopropionate ammonia-lyase  37.26 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0837  diaminopropionate ammonia-lyase  37.26 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3031  diaminopropionate ammonia-lyase  37.26 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02666  hypothetical protein  37.26 
 
 		 398 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  44.29 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0159  diaminopropionate ammonia-lyase  44.2 
 
 		 410 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  40 
 
 		 393 aa  209  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1434  diaminopropionate ammonia-lyase  36.07 
 
 		 413 aa  209  8e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  43.4 
 
 		 410 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4781  diaminopropionate ammonia-lyase  41.85 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  43.49 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  43.7 
 
 		 415 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  39.65 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1864  diaminopropionate ammonia-lyase  43.05 
 
 		 399 aa  192  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0500959  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  33.78 
 
 		 393 aa  186  9e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  42.32 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0639  diaminopropionate ammonia-lyase  31.69 
 
 		 410 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  41.89 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0057  diaminopropionate ammonia-lyase  43.49 
 
 		 410 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5230  diaminopropionate ammonia-lyase  43.37 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5629  diaminopropionate ammonia-lyase  43.37 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00139675 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4600  diaminopropionate ammonia-lyase  43.09 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175308 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6137  diaminopropionate ammonia-lyase  34.05 
 
 		 408 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6425  diaminopropionate ammonia-lyase  34.05 
 
 		 408 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2709  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.6 
 
 		 352 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1828  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.08 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3533  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.07 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  29.35 
 
 		 511 aa  87.4  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1343  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  41.83 
 
 		 368 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28 
 
 		 343 aa  82.8  0.000000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  29.08 
 
 		 515 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  30.39 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  28.19 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 443 aa  76.3  0.0000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  32.9 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  28.62 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  29.17 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  27.66 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  29.17 
 
 		 506 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0647  L-threonine ammonia-lyase  31.76 
 
 		 330 aa  73.6  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3582  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0458488  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0890  hypothetical protein  34.43 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  28.7 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3301  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.33 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0872906  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  30.04 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5602  putative threonine dehydratase  30.86 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.51 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  29.59 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  30.47 
 
 		 522 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  29.48 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  31.43 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  29.55 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3226  hypothetical protein  30.07 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  33.46 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2234  threonine dehydratase  33.2 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  27.95 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  31.17 
 
 		 511 aa  68.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3223  threonine dehydratase, biosynthetic  30.72 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  28.01 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0819  hypothetical protein  31.25 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  28.14 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  30.04 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  29.93 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme beta subunit  30.47 
 
 		 324 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  29.93 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  29.93 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.33 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  32.4 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  33.19 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  28.24 
 
 		 503 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  25.71 
 
 		 504 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>