More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2653 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  100 
 
 		 397 aa  823    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  66.84 
 
 		 408 aa  555  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  59.4 
 
 		 405 aa  501  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  55.08 
 
 		 400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  54.99 
 
 		 406 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.16044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0259  diaminopropionate ammonia-lyase  54.04 
 
 		 400 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1266  diaminopropionate ammonia-lyase  50.38 
 
 		 406 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0421  diaminopropionate ammonia-lyase  55.82 
 
 		 410 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1434  diaminopropionate ammonia-lyase  50.26 
 
 		 413 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  48.13 
 
 		 410 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1038  diaminopropionate ammonia-lyase  50.68 
 
 		 404 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  hitchhiker  0.00023872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1011  diaminopropionate ammonia-lyase  49.87 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000144159  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1070  diaminopropionate ammonia-lyase  49.6 
 
 		 404 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1103  diaminopropionate ammonia-lyase  50.41 
 
 		 404 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4080  diaminopropionate ammonia-lyase  47.21 
 
 		 392 aa  356  5e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0105  diaminopropionate ammonia-lyase  46.95 
 
 		 393 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02704  diaminopropionate ammonia-lyase  46.84 
 
 		 398 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  46.84 
 
 		 398 aa  345  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  46.84 
 
 		 398 aa  345  5e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02666  hypothetical protein  46.84 
 
 		 398 aa  346  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3031  diaminopropionate ammonia-lyase  46.84 
 
 		 398 aa  346  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3196  diaminopropionate ammonia-lyase  46.84 
 
 		 398 aa  345  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3004  diaminopropionate ammonia-lyase  46.84 
 
 		 398 aa  345  5e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0837  diaminopropionate ammonia-lyase  46.84 
 
 		 398 aa  346  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  47.01 
 
 		 390 aa  345  6e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  47.14 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0639  diaminopropionate ammonia-lyase  41.11 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0159  diaminopropionate ammonia-lyase  41.07 
 
 		 410 aa  265  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  40.26 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  40.28 
 
 		 410 aa  258  9e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  39.36 
 
 		 410 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  41.99 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  38.33 
 
 		 407 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  37.66 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5076  diaminopropionate ammonia-lyase  36.53 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0463571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  37.24 
 
 		 403 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1635  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.41 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.752486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0316  diaminopropionate ammonia-lyase  39.34 
 
 		 402 aa  229  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4781  diaminopropionate ammonia-lyase  37.17 
 
 		 403 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3023  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.04 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  38.54 
 
 		 415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3336  diaminopropionate ammonia-lyase  38.38 
 
 		 380 aa  210  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0394845  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1864  diaminopropionate ammonia-lyase  39.07 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0500959  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  36.73 
 
 		 401 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  37.22 
 
 		 414 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  35.98 
 
 		 414 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  35.28 
 
 		 753 aa  186  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4600  diaminopropionate ammonia-lyase  37.17 
 
 		 410 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5230  diaminopropionate ammonia-lyase  37.47 
 
 		 410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5629  diaminopropionate ammonia-lyase  37.47 
 
 		 410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00139675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0057  diaminopropionate ammonia-lyase  36.65 
 
 		 410 aa  182  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6137  diaminopropionate ammonia-lyase  35.16 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6425  diaminopropionate ammonia-lyase  35.16 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3533  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.4 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1828  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.57 
 
 		 345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1343  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.93 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2709  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.18 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  28.39 
 
 		 511 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  26.39 
 
 		 515 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  26.13 
 
 		 515 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  26.48 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  26.13 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1733  hypothetical protein  42.39 
 
 		 116 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000606559  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  29.93 
 
 		 509 aa  66.2  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  26.83 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  22.68 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  26.83 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  26.83 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  27.64 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  28.45 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  27.15 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  24.74 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  27.41 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.21 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  26.83 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0951  threonine dehydratase  26.47 
 
 		 517 aa  62  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  28.03 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  28.91 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  28.04 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  29.63 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1467  threonine dehydratase  26.47 
 
 		 517 aa  62  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  29.63 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4217  threonine dehydratase  30.6 
 
 		 514 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  28.39 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  28.39 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  28.39 
 
 		 514 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0158  threonine dehydratase  29.24 
 
 		 514 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4056  threonine dehydratase  29.24 
 
 		 514 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0486  threonine dehydratase  29.24 
 
 		 514 aa  60.5  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.824799  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  25 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  27.97 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  27.54 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.37 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  25.71 
 
 		 405 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  27.97 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  31.01 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  25.91 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  21.97 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  31.01 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  23.58 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>