More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5649 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  100 
 
 		 397 aa  795    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  67.85 
 
 		 403 aa  553  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5076  diaminopropionate ammonia-lyase  66.25 
 
 		 399 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0463571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4781  diaminopropionate ammonia-lyase  67.68 
 
 		 403 aa  524  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0316  diaminopropionate ammonia-lyase  64.9 
 
 		 402 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1864  diaminopropionate ammonia-lyase  61.79 
 
 		 399 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0500959  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0159  diaminopropionate ammonia-lyase  49.62 
 
 		 410 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  52.25 
 
 		 410 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  50.4 
 
 		 410 aa  338  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  47.12 
 
 		 407 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  46.7 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  45.02 
 
 		 401 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  46.7 
 
 		 396 aa  301  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  46.26 
 
 		 393 aa  296  5e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  46.35 
 
 		 414 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  45.34 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1266  diaminopropionate ammonia-lyase  40.91 
 
 		 406 aa  269  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4600  diaminopropionate ammonia-lyase  46.06 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5230  diaminopropionate ammonia-lyase  45.86 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5629  diaminopropionate ammonia-lyase  45.86 
 
 		 410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00139675 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0057  diaminopropionate ammonia-lyase  46.79 
 
 		 410 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  38.87 
 
 		 400 aa  259  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0259  diaminopropionate ammonia-lyase  37.77 
 
 		 400 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  38.07 
 
 		 405 aa  256  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  37.46 
 
 		 406 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.16044  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  39.27 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3196  diaminopropionate ammonia-lyase  39.27 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  39.27 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3004  diaminopropionate ammonia-lyase  39.27 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02704  diaminopropionate ammonia-lyase  38.98 
 
 		 398 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0837  diaminopropionate ammonia-lyase  38.98 
 
 		 398 aa  249  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3031  diaminopropionate ammonia-lyase  38.98 
 
 		 398 aa  249  8e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02666  hypothetical protein  38.98 
 
 		 398 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1434  diaminopropionate ammonia-lyase  38.96 
 
 		 413 aa  248  9e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3023  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  44.51 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  39.94 
 
 		 408 aa  244  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0105  diaminopropionate ammonia-lyase  37.4 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  37.66 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4080  diaminopropionate ammonia-lyase  37.43 
 
 		 392 aa  242  6e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1038  diaminopropionate ammonia-lyase  37.6 
 
 		 404 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  hitchhiker  0.00023872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1070  diaminopropionate ammonia-lyase  37.6 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973165 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  38.68 
 
 		 410 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1011  diaminopropionate ammonia-lyase  37.6 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000144159  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1103  diaminopropionate ammonia-lyase  37.33 
 
 		 404 aa  238  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0421  diaminopropionate ammonia-lyase  40.05 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  37.13 
 
 		 390 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6425  diaminopropionate ammonia-lyase  39.28 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  36.78 
 
 		 393 aa  227  3e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6137  diaminopropionate ammonia-lyase  39 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0639  diaminopropionate ammonia-lyase  34.71 
 
 		 410 aa  219  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1635  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.72 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.752486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3336  diaminopropionate ammonia-lyase  42.19 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0394845  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2709  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.14 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.879524 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  35.31 
 
 		 753 aa  164  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1828  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.65 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1343  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.68 
 
 		 368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3533  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.52 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  32.85 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1537  threonine synthase  33.33 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  26.97 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  27.76 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  27.46 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  28.46 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  28.33 
 
 		 507 aa  64.3  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6650  threonine dehydratase  28.84 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.987033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5805  threonine dehydratase  28.37 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6169  threonine dehydratase  28.37 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0794807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  31.76 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.75 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  25.11 
 
 		 511 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  29.91 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  28.08 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  24.78 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  27.3 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  23.6 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  29.49 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6018  threonine dehydratase  28.98 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  28.11 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  31.41 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  28.57 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5774  threonine dehydratase  30.59 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.154998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  26.96 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49047  l-threonine ammonia-lyase  30.3 
 
 		 606 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866709  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  26.3 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  29.49 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  28.85 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  26.6 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  27.23 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0890  hypothetical protein  29.58 
 
 		 333 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3473  threonine dehydratase  27.67 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  27.55 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  28.85 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  27.2 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0819  hypothetical protein  29.93 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  26.83 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0948  hypothetical protein  31.93 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0160024 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  33.33 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  28.17 
 
 		 527 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4146  hypothetical protein  26.25 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  27.09 
 
 		 509 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>