262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1621 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  100 
 
 		 440 aa  901    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  68.72 
 
 		 442 aa  619  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  48.02 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  48.27 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  47.81 
 
 		 446 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  48.27 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  48.27 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  47.58 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  47.79 
 
 		 443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  50.83 
 
 		 455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  47.33 
 
 		 443 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  48.02 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  46.85 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  49.41 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  48.45 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  48.23 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  46.45 
 
 		 451 aa  388  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  46.85 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  53.7 
 
 		 379 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  47.24 
 
 		 449 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  45.35 
 
 		 464 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  46.14 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  45.91 
 
 		 438 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  46.14 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  48.43 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  46.36 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  46.14 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  46.14 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  47.24 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  44.7 
 
 		 445 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  45.91 
 
 		 442 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  46.77 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  45.91 
 
 		 442 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  45.81 
 
 		 441 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  46.54 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  44.63 
 
 		 432 aa  368  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  49.2 
 
 		 444 aa  362  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  43.48 
 
 		 449 aa  362  9e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  48.61 
 
 		 441 aa  358  7e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  44.42 
 
 		 440 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  43.74 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  44.19 
 
 		 440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  45 
 
 		 443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  44.19 
 
 		 440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  44.19 
 
 		 440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  44.19 
 
 		 440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  43.39 
 
 		 443 aa  356  5e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  46.27 
 
 		 438 aa  355  8.999999999999999e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  48.01 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  44.55 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  47.51 
 
 		 422 aa  351  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  45.43 
 
 		 461 aa  346  4e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  44.78 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  44.78 
 
 		 445 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  47.86 
 
 		 445 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  47.62 
 
 		 445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  47.86 
 
 		 445 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  48.1 
 
 		 429 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  39.9 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  51.25 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  51.25 
 
 		 282 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  30.5 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.46 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  29.44 
 
 		 520 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  41.38 
 
 		 155 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  41.38 
 
 		 155 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  27.76 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  27.62 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  40 
 
 		 110 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4781  diaminopropionate ammonia-lyase  29.69 
 
 		 403 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  31.17 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  31.17 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0105  diaminopropionate ammonia-lyase  25.3 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4359  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.38 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  26.53 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  30.74 
 
 		 519 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4080  diaminopropionate ammonia-lyase  25.3 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  26.34 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  24.46 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4126  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.56 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982421  normal  0.0175954 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  26.34 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  27.95 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  22.7 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  27.04 
 
 		 531 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  25.54 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  25.54 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5076  diaminopropionate ammonia-lyase  24.41 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0463571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2749  serine/threonine dehydratase  24.89 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.976068  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  25.32 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  27.23 
 
 		 507 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  22.54 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4177  serine/threonine dehydratase  25.87 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  27.23 
 
 		 507 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  27.23 
 
 		 507 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  26 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  24.51 
 
 		 514 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  26.41 
 
 		 515 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  23.63 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  26.4 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>