151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A1907 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  93.91 
 
 
443 aa  833    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  95.26 
 
 
446 aa  849    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  95.71 
 
 
446 aa  855    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  95.94 
 
 
446 aa  855    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  100 
 
 
443 aa  910    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  95.26 
 
 
446 aa  849    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  95.26 
 
 
464 aa  849    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  89.62 
 
 
443 aa  798    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  89.62 
 
 
443 aa  800    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  91.87 
 
 
445 aa  808    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  68.81 
 
 
464 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  65.53 
 
 
459 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  62.99 
 
 
441 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  62.79 
 
 
442 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  62.79 
 
 
442 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  61.72 
 
 
443 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  62.79 
 
 
442 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  62.79 
 
 
442 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  62.79 
 
 
442 aa  537  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  63.02 
 
 
442 aa  538  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  62.79 
 
 
442 aa  537  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  62.79 
 
 
438 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  60.91 
 
 
440 aa  531  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  61.19 
 
 
443 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  61.65 
 
 
443 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  60.68 
 
 
440 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  60.91 
 
 
440 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  60.91 
 
 
440 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  60.68 
 
 
440 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  63.08 
 
 
441 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  61.43 
 
 
449 aa  522  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  62.03 
 
 
461 aa  524  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  58.96 
 
 
449 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  62.24 
 
 
432 aa  520  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  58.7 
 
 
445 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  59.18 
 
 
445 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  58 
 
 
451 aa  512  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  60.87 
 
 
434 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  64.66 
 
 
422 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  58.89 
 
 
448 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  59.36 
 
 
445 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  60.91 
 
 
446 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  58.43 
 
 
448 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  54.44 
 
 
456 aa  490  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  58.41 
 
 
438 aa  484  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  47.33 
 
 
440 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  50.46 
 
 
455 aa  411  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  48.47 
 
 
443 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  44.34 
 
 
442 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  46.12 
 
 
446 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  46.39 
 
 
473 aa  373  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  46.19 
 
 
451 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  46.67 
 
 
451 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  49.17 
 
 
379 aa  353  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  44.52 
 
 
444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  44.74 
 
 
445 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  44.74 
 
 
445 aa  319  6e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  44.5 
 
 
445 aa  318  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  44.83 
 
 
429 aa  300  3e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  50.75 
 
 
283 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  50.75 
 
 
282 aa  246  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  53.85 
 
 
110 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  36 
 
 
155 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  36 
 
 
155 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  23.08 
 
 
408 aa  60.8  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  24.9 
 
 
520 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  22.71 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  20.88 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  23.21 
 
 
410 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  25.33 
 
 
408 aa  56.6  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  22.78 
 
 
505 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2835  D-serine dehydratase (D-serine deaminase) (DSD)  66.67 
 
 
46 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  hitchhiker  0.00000000706705 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4366  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  25.78 
 
 
315 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3309  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  26.12 
 
 
319 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0279719  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  24.42 
 
 
290 aa  54.7  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  22.57 
 
 
397 aa  54.3  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  22.36 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0128  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.02 
 
 
343 aa  54.3  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0358  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.46 
 
 
318 aa  53.5  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1667  normal  0.162228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02704  diaminopropionate ammonia-lyase  25.64 
 
 
398 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  25.64 
 
 
398 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  25.64 
 
 
398 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3031  diaminopropionate ammonia-lyase  25.64 
 
 
398 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3196  diaminopropionate ammonia-lyase  25.64 
 
 
398 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02666  hypothetical protein  25.64 
 
 
398 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0837  diaminopropionate ammonia-lyase  25.64 
 
 
398 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3004  diaminopropionate ammonia-lyase  25.64 
 
 
398 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  24.21 
 
 
530 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6209  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.26 
 
 
319 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0577806 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  23.17 
 
 
393 aa  52  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  23.64 
 
 
291 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  23.9 
 
 
519 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0421  diaminopropionate ammonia-lyase  24.66 
 
 
410 aa  51.2  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  23.18 
 
 
405 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2099  hypothetical protein  24.23 
 
 
328 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  22.57 
 
 
390 aa  50.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  24.05 
 
 
514 aa  49.7  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  22.73 
 
 
501 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  20.18 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  22.65 
 
 
531 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>