61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0329 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  100 
 
 		 110 aa  229  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  62 
 
 		 459 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  56.04 
 
 		 443 aa  103  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  57.14 
 
 		 443 aa  103  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  55.32 
 
 		 446 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  55.32 
 
 		 446 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  55.32 
 
 		 464 aa  100  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  57.3 
 
 		 445 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  55.32 
 
 		 446 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  55.32 
 
 		 446 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  57.3 
 
 		 443 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  53.85 
 
 		 443 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  51.19 
 
 		 464 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  53.49 
 
 		 445 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  48.84 
 
 		 449 aa  87.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  53.49 
 
 		 448 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  52.33 
 
 		 448 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  47.67 
 
 		 440 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  48.24 
 
 		 440 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  48.24 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  48.24 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  49.4 
 
 		 445 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  47.62 
 
 		 443 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  47.67 
 
 		 440 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  47.67 
 
 		 438 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  45.24 
 
 		 443 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  47.13 
 
 		 422 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  48.28 
 
 		 442 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  48.28 
 
 		 442 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  48.28 
 
 		 442 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  48.28 
 
 		 442 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  48.28 
 
 		 442 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  48.24 
 
 		 434 aa  73.9  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  41.86 
 
 		 455 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  45.88 
 
 		 432 aa  73.6  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  45.45 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  45.78 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  46.51 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  47.13 
 
 		 442 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  49.37 
 
 		 451 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  46.51 
 
 		 446 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  47.13 
 
 		 442 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  50 
 
 		 461 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  44.71 
 
 		 456 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  41.67 
 
 		 443 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  44.71 
 
 		 438 aa  70.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  42.35 
 
 		 449 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  40.7 
 
 		 451 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  45.45 
 
 		 446 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  46.91 
 
 		 441 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  40 
 
 		 440 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  39.53 
 
 		 451 aa  67.4  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  39.33 
 
 		 445 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  38.37 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  44.3 
 
 		 444 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  41.89 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  41.89 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  41.89 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  41.89 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  41.89 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  32.97 
 
 		 473 aa  55.1  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>