104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4082 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02276  D-serine dehydratase  88.91 
 
 		 442 aa  791    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1291  D-serine ammonia-lyase  88.69 
 
 		 442 aa  789    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4659  D-serine dehydratase  71.17 
 
 		 443 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347338  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0021  D-serine dehydratase  81.69 
 
 		 434 aa  697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0362  D-serine dehydratase  71.66 
 
 		 441 aa  635    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2503  D-serine dehydratase  88.91 
 
 		 442 aa  791    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.270405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2652  D-serine dehydratase  88.91 
 
 		 442 aa  791    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1303  D-serine dehydratase  88.69 
 
 		 442 aa  789    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.29121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2516  D-serine dehydratase  89.02 
 
 		 438 aa  787    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  87.14 
 
 		 422 aa  732    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4082  D-serine dehydratase  100 
 
 		 440 aa  906    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4132  D-serine dehydratase  100 
 
 		 440 aa  906    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.293568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4011  D-serine dehydratase  99.55 
 
 		 440 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4027  D-serine dehydratase  99.77 
 
 		 440 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4190  D-serine dehydratase  99.77 
 
 		 440 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3597  D-serine dehydratase  88.69 
 
 		 442 aa  790    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277726 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02237  hypothetical protein  88.91 
 
 		 442 aa  791    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003747  D-serine dehydratase  73.39 
 
 		 443 aa  644    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0243202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02609  D-serine dehydratase  71.56 
 
 		 443 aa  631  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3449  D-serine dehydratase  71.92 
 
 		 441 aa  633  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2515  D-serine dehydratase  70.78 
 
 		 445 aa  602  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.790637 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  69 
 
 		 432 aa  589  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3070  D-serine dehydratase  65.81 
 
 		 449 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3112  D-serine dehydratase  65.58 
 
 		 445 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3545  D-serine dehydratase  62.41 
 
 		 443 aa  552  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1855  D-serine dehydratase  61.96 
 
 		 443 aa  544  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.478558  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20650  D-serine dehydratase  63.36 
 
 		 448 aa  542  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00676968  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1653  D-serine dehydratase  61.14 
 
 		 446 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1784  D-serine dehydratase  61.14 
 
 		 446 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.936434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1773  D-serine dehydratase  63.13 
 
 		 448 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1650  D-serine dehydratase  62.27 
 
 		 445 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1796  D-serine dehydratase  61.28 
 
 		 443 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.395569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1833  D-serine dehydratase  61.14 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1631  D-serine dehydratase  60.68 
 
 		 446 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1600  D-serine dehydratase  60.91 
 
 		 446 aa  535  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.99334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3266  D-serine dehydratase  66.74 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1907  D-serine dehydratase  60.91 
 
 		 443 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000531501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3934  D-serine ammonia-lyase  60.99 
 
 		 451 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1151  D-serine ammonia-lyase  63.13 
 
 		 461 aa  521  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2017  D-serine dehydratase  59.68 
 
 		 464 aa  511  1e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4129  D-serine ammonia-lyase  59 
 
 		 456 aa  505  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2763  D-serine dehydratase  58.31 
 
 		 459 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3826  D-serine dehydratase  57.67 
 
 		 445 aa  504  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.419593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2895  D-serine dehydratase  58.68 
 
 		 449 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0789  D-serine ammonia-lyase  51.4 
 
 		 438 aa  440  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000399356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2915  D-serine dehydratase  47.84 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.464648  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4614  D-serine dehydratase  51.49 
 
 		 455 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2092  D-serine dehydratase  46.03 
 
 		 442 aa  378  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.962214  normal  0.0544874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1621  D-serine dehydratase  44.19 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.48816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1364  D-serine dehydratase  45.29 
 
 		 446 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0658416 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0657  D-serine dehydratase  45 
 
 		 473 aa  355  1e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  48.39 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0245  D-serine dehydratase  44.22 
 
 		 444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  45.41 
 
 		 451 aa  322  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  45.18 
 
 		 451 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0232  D-serine dehydratase  47.12 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.910645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2980  D-serine dehydratase  45.03 
 
 		 445 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2856  D-serine dehydratase  45.03 
 
 		 445 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.298475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1220  D-serine dehydratase  44.8 
 
 		 445 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1577  D-serine dehydratase  51.25 
 
 		 282 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1763  D-serine dehydratase  51.25 
 
 		 283 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.634059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0329  D-serine dehydratase  48.24 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  23.89 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  25 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  23.57 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  26.27 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  25.35 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  25.35 
 
 		 403 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  25.35 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  25.21 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1576  D-serine ammonia-lyase  35.88 
 
 		 155 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1762  D-serine dehydratase  35.88 
 
 		 155 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  21.4 
 
 		 753 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0358  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  24.79 
 
 		 318 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.1667  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  21.98 
 
 		 403 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  23.05 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2493  tryptophan synthase subunit beta  25 
 
 		 451 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  22.82 
 
 		 393 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0567  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.61 
 
 		 301 aa  47.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000159646  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  24.87 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1293  tryptophan synthase subunit beta  23.53 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387586  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  22.87 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2379  tryptophan synthase subunit beta  24.12 
 
 		 451 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.20256  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0463  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  24.04 
 
 		 327 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0763  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  24.04 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0168407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3192  cysteine synthase  24.04 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0763679  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6176  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28 
 
 		 322 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0316  diaminopropionate ammonia-lyase  23.24 
 
 		 402 aa  44.3  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08057  Cysteine synthase (CSase)(EC 2.5.1.47)(O-acetylserine sulfhydrylase)(O-acetylserine (thiol)-lyase)(OAS-TL) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P50867]  24.14 
 
 		 370 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3711  tryptophan synthase subunit beta  24.43 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0746  cysteine synthases  26.92 
 
 		 305 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  22.02 
 
 		 303 aa  44.3  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  23.11 
 
 		 312 aa  43.5  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1011  diaminopropionate ammonia-lyase  21.82 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000144159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  20.08 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  23.64 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  24.82 
 
 		 309 aa  43.5  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1038  diaminopropionate ammonia-lyase  21.82 
 
 		 404 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  hitchhiker  0.00023872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1103  diaminopropionate ammonia-lyase  21.82 
 
 		 404 aa  43.5  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0421  diaminopropionate ammonia-lyase  22.12 
 
 		 410 aa  43.5  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>