More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3192 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3192  cysteine synthase  100 
 
 		 323 aa  644    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0763679  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0763  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  99.02 
 
 		 321 aa  608  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0168407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0463  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  99.67 
 
 		 327 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0269  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  65.9 
 
 		 331 aa  386  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2604  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  59.93 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000388895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  42.11 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  40.26 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  39.93 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  39.93 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  40.26 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  37.99 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  37.13 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  37.66 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  39.29 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  39.29 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  39.81 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  41.97 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  37.5 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  41.12 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  39.8 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  39.54 
 
 		 301 aa  192  8e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1605  O-acetylserine (thiol)-lyase  39.31 
 
 		 343 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  40.13 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  40.66 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  39.81 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  39.33 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  41.67 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  39.47 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4297  cysteine synthase  39.37 
 
 		 321 aa  185  7e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  39.8 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  37.42 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  38.03 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  35.54 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0509  cysteine synthase  40.52 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.445859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  39.46 
 
 		 290 aa  183  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  41.53 
 
 		 309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  40.58 
 
 		 307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  39.8 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2304  cysteine synthase  41.1 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  37.79 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  42.07 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  39.93 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  37.83 
 
 		 306 aa  182  8.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3593  cysteine synthase  40.91 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  40.07 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  41.88 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  38.36 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  37.58 
 
 		 306 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  37.96 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  38.16 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0955  cysteine synthase A  42.62 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3006  cysteine synthase A  39.8 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.599463  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3723  cysteine synthase  39.8 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  39.54 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4175  cysteine synthase  40.97 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  38.33 
 
 		 299 aa  179  8e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  39.34 
 
 		 305 aa  179  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  39.94 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  40.26 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  40.26 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  40.26 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  39.93 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  40.26 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  39.67 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  40.26 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  38.41 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  39.55 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  40.26 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  40.46 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  40.26 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  36.63 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  40.72 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  39.67 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6440  cysteine synthase A  38.24 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  40.19 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  36.77 
 
 		 773 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  38.26 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  38.92 
 
 		 310 aa  175  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1448  cysteine synthase A  38.51 
 
 		 306 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  39.61 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1438  cysteine synthase A  38.24 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.412307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1362  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.69 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  39.47 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6147  cysteine synthase A  38.24 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  39.94 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  36.96 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1678  cysteine synthase A  38.56 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.423565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1875  cysteine synthase A  38.56 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1691  cysteine synthase A  38.56 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1954  cysteine synthase A  38.56 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_94354  predicted protein  34.38 
 
 		 387 aa  172  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.25713  hitchhiker  0.00194835 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  38.73 
 
 		 317 aa  173  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  38.29 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  40.07 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  42.24 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1837  cysteine synthase A  38.56 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3506  cysteine synthase A  38.56 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1653  cysteine synthase A  38.24 
 
 		 305 aa  172  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  42.24 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  36.72 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>