More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0269 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0269  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 331 aa  668    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0463  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  66.78 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0763  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  66.45 
 
 		 321 aa  385  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0168407  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3192  cysteine synthase  65.9 
 
 		 323 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0763679  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2604  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  57.34 
 
 		 300 aa  335  9e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000388895  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  43.77 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  42.57 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  42.37 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  45.15 
 
 		 307 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  45.15 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0266  cysteine synthase A  44.1 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0459085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  41.08 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  41.08 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  47.68 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  41.95 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  41.28 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  41.41 
 
 		 299 aa  203  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  43 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2430  cysteine synthase A  43.96 
 
 		 306 aa  202  7e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  36.55 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  39.6 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0264  cysteine synthase A  43.06 
 
 		 290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  38.69 
 
 		 461 aa  199  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1605  O-acetylserine (thiol)-lyase  40.53 
 
 		 343 aa  199  7e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1224  cysteine synthase A  39.46 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.47956e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  42.66 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  40.74 
 
 		 299 aa  196  6e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  40.73 
 
 		 306 aa  196  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  40.73 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  39.32 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  42.57 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  41.08 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  37.12 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1091  cysteine synthase  42.72 
 
 		 303 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000826995  decreased coverage  0.00308217 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  39.6 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3907  cysteine synthase A  42.43 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  43.18 
 
 		 307 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  42.86 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  41.78 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  43.79 
 
 		 309 aa  190  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  41.95 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  37.21 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1438  cysteine synthase A  40.33 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  42.47 
 
 		 309 aa  189  8e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  41 
 
 		 297 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1589  cysteine synthase  40.6 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424086  normal  0.274481 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  39.73 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  42.76 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  40.26 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  44.3 
 
 		 309 aa  187  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  41.22 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  39.53 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  41.18 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0955  cysteine synthase A  43.91 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.1 
 
 		 479 aa  186  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  36.64 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  40.52 
 
 		 320 aa  186  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2304  cysteine synthase  40.39 
 
 		 310 aa  186  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  43.38 
 
 		 317 aa  185  8e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  40 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  42.38 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  41.22 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  37.63 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  42.28 
 
 		 320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  43.89 
 
 		 317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  41.14 
 
 		 305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  39.39 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0567  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.67 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000159646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  41.41 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  36.3 
 
 		 459 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3210  cysteine synthase A  39.81 
 
 		 319 aa  182  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.112501  normal  0.950187 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  44.37 
 
 		 327 aa  182  9.000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  42.42 
 
 		 308 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3460  cysteine synthases  40.46 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  40.75 
 
 		 297 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  39.74 
 
 		 304 aa  182  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  42.05 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  42.19 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2500  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  36 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  38.74 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1228  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.57 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  40.6 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  41.47 
 
 		 308 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  42.42 
 
 		 308 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  39.2 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  37.04 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.57 
 
 		 307 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  38.54 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.33 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  38.83 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1734  cysteine synthase  40.48 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.30022  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  41.61 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  37.1 
 
 		 459 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1442  cysteine synthase  39.8 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  39.27 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  40.2 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  41.61 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  41.61 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  41.61 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  39.93 
 
 		 301 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>