More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1605 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1605  O-acetylserine (thiol)-lyase  100 
 
 		 343 aa  698    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  46.05 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1087  cysteine synthase  45.85 
 
 		 303 aa  259  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  45.36 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09450  cysteine synthase  46.23 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  44.26 
 
 		 310 aa  256  6e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1534  cysteine synthase A  43.89 
 
 		 298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  43.61 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  43.61 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  43.61 
 
 		 304 aa  249  4e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1655  cysteine synthase  42.95 
 
 		 315 aa  249  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.561904  normal  0.310159 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  45.75 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  44.92 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  45.36 
 
 		 320 aa  247  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  42.43 
 
 		 304 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0076  cysteine synthase A  47.04 
 
 		 307 aa  245  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00534286 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0822  cysteine synthase A  46.75 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.326455 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0549  cysteine synthase A  45.13 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000133483 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  42.15 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  45.25 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  47.39 
 
 		 305 aa  243  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  44.52 
 
 		 311 aa  243  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  45.03 
 
 		 320 aa  243  5e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  44.77 
 
 		 309 aa  242  6e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  44.59 
 
 		 309 aa  242  6e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  45.9 
 
 		 309 aa  242  6e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  40.4 
 
 		 461 aa  241  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  42.3 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2658  cysteine synthase  45.51 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.556672 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1362  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.46 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314138  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  46.6 
 
 		 309 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  41.08 
 
 		 463 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  44.48 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  46.08 
 
 		 311 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0832  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  44.92 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00340267  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  45.42 
 
 		 308 aa  239  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0067  cysteine synthase A  47.37 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0063  cysteine synthase  47.37 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0063  cysteine synthase (cysteine synthase A) (O-acetylserine sulfhydrylase)  47.37 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0051359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0067  cysteine synthase A  47.37 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5241  cysteine synthase A  47.37 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0191728 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  45.07 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0079  cysteine synthase A  47.37 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  44.05 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  43.14 
 
 		 311 aa  238  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  43.73 
 
 		 309 aa  238  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  45.78 
 
 		 308 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  42.9 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0075  cysteine synthase A  47.37 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0149  cysteine synthase  41.94 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  45.1 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0063  cysteine synthase A  47.04 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0952  cysteine synthase  46.23 
 
 		 311 aa  235  8e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.820864  normal  0.859633 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0066  cysteine synthase A  47.04 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  45.78 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  42.86 
 
 		 309 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  44.26 
 
 		 308 aa  235  9e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  47.37 
 
 		 307 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  45.13 
 
 		 310 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  44.63 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2988  cysteine synthase  44.67 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571381  normal  0.7688 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1792  cysteine synthase  43.61 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000703556  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  43.38 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  44.77 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  44.19 
 
 		 327 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  44.37 
 
 		 311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  43.46 
 
 		 308 aa  233  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  44.48 
 
 		 330 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0065  cysteine synthase A  46.71 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  43.93 
 
 		 309 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  43.93 
 
 		 308 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05340  cysteine synthase  44.26 
 
 		 304 aa  232  8.000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0535  cysteine synthase A  44.33 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0678503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  45.62 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  45.75 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  43.73 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0067  cysteine synthase A  46.71 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000200639  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  41.8 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  44.19 
 
 		 327 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  41.45 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  44.16 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  43.65 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  43.83 
 
 		 309 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02140  cysteine synthase  42.17 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.445604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1657  cysteine synthase A  43.24 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.183706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  43.83 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  41.48 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3363  cysteine synthase A  43.55 
 
 		 324 aa  229  6e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.886902 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  44.92 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  45.75 
 
 		 311 aa  229  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1822  cysteine synthase A  40.98 
 
 		 302 aa  229  7e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.470327  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  44.59 
 
 		 306 aa  229  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  44.34 
 
 		 319 aa  228  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  45.45 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  44.26 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  43.46 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.38 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4653  cysteine synthase  42.43 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  42.16 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  44.44 
 
 		 292 aa  228  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>