249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1499 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0159  diaminopropionate ammonia-lyase  83.86 
 
 		 410 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  100 
 
 		 410 aa  832    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4067  diaminopropionate ammonia-lyase  70.79 
 
 		 407 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4533  diaminopropionate ammonia-lyase  62.34 
 
 		 410 aa  476  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4911  diaminopropionate ammonia-lyase  57 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04926  diaminopropionate ammonia-lyase  53.65 
 
 		 393 aa  398  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5649  diaminopropionate ammonia-lyase  49.11 
 
 		 397 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0316  diaminopropionate ammonia-lyase  52.89 
 
 		 402 aa  352  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0630  diaminopropionate ammonia-lyase  47.09 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140013 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5076  diaminopropionate ammonia-lyase  46.06 
 
 		 399 aa  332  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0463571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3965  diaminopropionate ammonia-lyase  46.94 
 
 		 415 aa  319  6e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456093  normal  0.0239506 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6425  diaminopropionate ammonia-lyase  45.17 
 
 		 408 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6137  diaminopropionate ammonia-lyase  47.61 
 
 		 408 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4781  diaminopropionate ammonia-lyase  50.72 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771046  normal  0.0649173 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2576  diaminopropionate ammonia-lyase  45.36 
 
 		 401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.264217  normal  0.398915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1864  diaminopropionate ammonia-lyase  49.35 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0500959  normal  0.41026 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4908  diaminopropionate ammonia-lyase  45.99 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.509638  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1499  diaminopropionate ammonia-lyase  40.43 
 
 		 406 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.16044  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5456  diaminopropionate ammonia-lyase  45.99 
 
 		 414 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.372384 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5230  diaminopropionate ammonia-lyase  47.39 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.907828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5629  diaminopropionate ammonia-lyase  47.39 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00139675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2963  diaminopropionate ammonia-lyase  39.68 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.917683  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4600  diaminopropionate ammonia-lyase  47.15 
 
 		 410 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175308 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0057  diaminopropionate ammonia-lyase  46.4 
 
 		 410 aa  276  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0259  diaminopropionate ammonia-lyase  38.87 
 
 		 400 aa  273  6e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.167418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1266  diaminopropionate ammonia-lyase  40.73 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2653  diaminopropionate ammonia-lyase  40 
 
 		 397 aa  270  4e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1038  diaminopropionate ammonia-lyase  41.19 
 
 		 404 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  hitchhiker  0.00023872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1103  diaminopropionate ammonia-lyase  41.45 
 
 		 404 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.624522 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1662  diaminopropionate ammonia-lyase  40.44 
 
 		 405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1070  diaminopropionate ammonia-lyase  41.19 
 
 		 404 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000973165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1011  diaminopropionate ammonia-lyase  41.19 
 
 		 404 aa  265  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000144159  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0239  diaminopropionate ammonia-lyase  39.28 
 
 		 408 aa  265  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000784643  normal  0.351019 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02704  diaminopropionate ammonia-lyase  40.85 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3031  diaminopropionate ammonia-lyase  40.85 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02666  hypothetical protein  40.85 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0837  diaminopropionate ammonia-lyase  40.85 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0821  diaminopropionate ammonia-lyase  40.85 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3004  diaminopropionate ammonia-lyase  40.85 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3196  diaminopropionate ammonia-lyase  40.85 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4161  diaminopropionate ammonia-lyase  40.85 
 
 		 398 aa  263  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0421  diaminopropionate ammonia-lyase  43.24 
 
 		 410 aa  259  6e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1434  diaminopropionate ammonia-lyase  37.17 
 
 		 413 aa  250  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0105  diaminopropionate ammonia-lyase  38.83 
 
 		 393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4080  diaminopropionate ammonia-lyase  38.98 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2030  diaminopropionate ammonia-lyase  38.42 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.382998  normal  0.0279866 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2043  diaminopropionate ammonia-lyase  41.8 
 
 		 410 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3023  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  40.22 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0639  diaminopropionate ammonia-lyase  33.51 
 
 		 410 aa  223  4e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1422  diaminopropionate ammonia-lyase  35.08 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227055 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1635  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.1 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.752486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3336  diaminopropionate ammonia-lyase  45.25 
 
 		 380 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0394845  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2709  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  41.03 
 
 		 352 aa  151  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.201895  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1828  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.35 
 
 		 345 aa  146  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.188606 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  33.24 
 
 		 753 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3533  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.87 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1343  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.74 
 
 		 368 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1537  threonine synthase  33.12 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  28.25 
 
 		 511 aa  72.8  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  25.68 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2925  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  26.99 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.412032 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  28.74 
 
 		 507 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  23.81 
 
 		 514 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  26.52 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  29.35 
 
 		 514 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  25.63 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  25.27 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  28.69 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  24.15 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2428  D-serine dehydratase  26.76 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.24 
 
 		 304 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3083  threonine dehydratase  25.81 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.490718  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  24.07 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3143  threonine dehydratase  25.81 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449239  normal  0.1577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5685  threonine dehydratase  31.14 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000112731  normal  0.257645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3103  threonine dehydratase  25.81 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.832581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2496  threonine dehydratase  25.76 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1624  D-serine dehydratase  25.77 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  30.43 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  24.68 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  24 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  30.43 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2250  D-serine dehydratase  25.77 
 
 		 451 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.81638 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  22.93 
 
 		 404 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0819  hypothetical protein  29.31 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  23.25 
 
 		 403 aa  57  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2783  threonine dehydratase  26.71 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642474  normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3416  threonine dehydratase, biosynthetic  25.79 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175327 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  25 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39224  predicted protein  28.78 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0161526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1597  threonine dehydratase  26.64 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0207  threonine dehydratase  25.82 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.743281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5343  threonine dehydratase  25.82 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0929  threonine dehydratase  24.88 
 
 		 527 aa  54.7  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767774 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2885  threonine dehydratase  25 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1718  D-serine dehydratase  23.73 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1431  threonine dehydratase  30.3 
 
 		 509 aa  53.9  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0729808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0644  threonine dehydratase  26.07 
 
 		 549 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0883544 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  24.38 
 
 		 511 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  26.42 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>