More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1537 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1537  threonine synthase  100 
 
 
325 aa  648    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  31.75 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  31.11 
 
 
404 aa  134  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  31.61 
 
 
422 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3076  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.2 
 
 
388 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  30.48 
 
 
404 aa  126  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  30.55 
 
 
399 aa  126  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  29.65 
 
 
405 aa  125  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  25.88 
 
 
368 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  31.75 
 
 
348 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  30.16 
 
 
403 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  30.48 
 
 
401 aa  123  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  30.16 
 
 
401 aa  122  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  29.68 
 
 
414 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  28.57 
 
 
404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  30.84 
 
 
419 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  36.73 
 
 
356 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  28.94 
 
 
401 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  28.85 
 
 
402 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  27.22 
 
 
368 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  27.8 
 
 
368 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  31.43 
 
 
351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  32.17 
 
 
331 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  26.2 
 
 
354 aa  116  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  29.55 
 
 
391 aa  115  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  29.22 
 
 
368 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  31.38 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  32.35 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  29.02 
 
 
377 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1025  threonine synthase  29.02 
 
 
377 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  28.8 
 
 
353 aa  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  29.75 
 
 
394 aa  113  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  31.83 
 
 
346 aa  112  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  28.8 
 
 
353 aa  113  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  28.34 
 
 
346 aa  112  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  29.52 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  29.02 
 
 
363 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  30.28 
 
 
345 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  29.22 
 
 
362 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  30.2 
 
 
348 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  29.49 
 
 
408 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  30.2 
 
 
348 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  28.89 
 
 
354 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  31.88 
 
 
349 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  30.4 
 
 
396 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  29.1 
 
 
377 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  30.16 
 
 
356 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  27.1 
 
 
421 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  27.69 
 
 
402 aa  107  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  27.24 
 
 
348 aa  106  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  27.1 
 
 
371 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  28.26 
 
 
360 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  29.78 
 
 
352 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  30.41 
 
 
352 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  31.61 
 
 
353 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  29.78 
 
 
352 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  29.78 
 
 
352 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  29.78 
 
 
352 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  30.45 
 
 
403 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  29.78 
 
 
352 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  29.78 
 
 
352 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  29.78 
 
 
352 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  29.78 
 
 
352 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2321  threonine synthase  28.53 
 
 
369 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  27.71 
 
 
366 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  29.81 
 
 
359 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1254  threonine synthase  28.79 
 
 
363 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  28.98 
 
 
357 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  29.78 
 
 
352 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  27.62 
 
 
351 aa  102  6e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  31.19 
 
 
346 aa  102  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  29.45 
 
 
402 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  27.27 
 
 
375 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  30 
 
 
351 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  29.28 
 
 
422 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  28.62 
 
 
360 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  25.96 
 
 
373 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  28.62 
 
 
360 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  28.62 
 
 
360 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  27.62 
 
 
348 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  31.33 
 
 
360 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  32.63 
 
 
403 aa  100  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30231  threonine synthase  29.49 
 
 
352 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  29.47 
 
 
352 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1022  threonine synthase  32.7 
 
 
357 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  28.12 
 
 
367 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  29.21 
 
 
359 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  24.92 
 
 
416 aa  99.8  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  34.78 
 
 
352 aa  99.8  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  29.37 
 
 
347 aa  99.8  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  28.62 
 
 
405 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  27.81 
 
 
427 aa  99  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  31.05 
 
 
355 aa  99  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  29.02 
 
 
354 aa  98.6  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  26.89 
 
 
367 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  32.76 
 
 
366 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  29.56 
 
 
348 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09880  L-threonine synthase  29.9 
 
 
355 aa  97.1  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.704092  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0665  threonine synthase  29.81 
 
 
413 aa  96.7  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  28.35 
 
 
419 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>