More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3186 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  100 
 
 
346 aa  700    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  89.31 
 
 
346 aa  611  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  70.29 
 
 
357 aa  488  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  56.1 
 
 
351 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  58.84 
 
 
348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  59.48 
 
 
348 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  59.18 
 
 
348 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  56.1 
 
 
351 aa  404  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  54.2 
 
 
354 aa  406  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  58.26 
 
 
348 aa  404  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  61.04 
 
 
371 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  58.65 
 
 
346 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  59.42 
 
 
348 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  58.86 
 
 
363 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  60.83 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  62.2 
 
 
353 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  58.05 
 
 
362 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  61.63 
 
 
353 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  57.39 
 
 
353 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  57.39 
 
 
353 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  60.49 
 
 
351 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  59.77 
 
 
345 aa  387  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1254  threonine synthase  58.48 
 
 
363 aa  386  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  60.06 
 
 
352 aa  381  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  60 
 
 
352 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  60.06 
 
 
352 aa  381  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1022  threonine synthase  60.63 
 
 
357 aa  381  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  59.7 
 
 
352 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  60 
 
 
352 aa  382  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  60.06 
 
 
352 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  60.37 
 
 
352 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  60.06 
 
 
352 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  60.06 
 
 
352 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  60.06 
 
 
352 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  61.05 
 
 
374 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  56.32 
 
 
377 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  56.6 
 
 
349 aa  381  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  54.05 
 
 
356 aa  375  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  56.36 
 
 
354 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  59.7 
 
 
354 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  55.46 
 
 
377 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0319  threonine synthase  61.61 
 
 
352 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.147741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  58.95 
 
 
351 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1025  threonine synthase  55.46 
 
 
377 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  60.47 
 
 
351 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  59.88 
 
 
361 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  60.06 
 
 
352 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  58.43 
 
 
352 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  54.88 
 
 
368 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  53.74 
 
 
368 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  58.77 
 
 
366 aa  368  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  59.44 
 
 
352 aa  369  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  54.36 
 
 
352 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  55.79 
 
 
368 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29950  threonine synthase  56.93 
 
 
364 aa  364  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  52.74 
 
 
404 aa  363  2e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  61.59 
 
 
370 aa  363  3e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  52.45 
 
 
404 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  57.61 
 
 
352 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  61.03 
 
 
377 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  58.26 
 
 
355 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  53.16 
 
 
367 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  58.54 
 
 
368 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4032  threonine synthase  58.6 
 
 
349 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.969378  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6155  threonine synthase  56.56 
 
 
358 aa  357  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  60.37 
 
 
353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  51.86 
 
 
403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0631  threonine synthase  59.65 
 
 
365 aa  355  5e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  hitchhiker  0.00263749 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  51.87 
 
 
404 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  53.16 
 
 
367 aa  355  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  51.72 
 
 
367 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  51.01 
 
 
404 aa  353  4e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3650  threonine synthase  60.18 
 
 
349 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1808  threonine synthase  52.87 
 
 
367 aa  350  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.71327  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  58.43 
 
 
356 aa  348  7e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08030  threonine synthase  54.6 
 
 
370 aa  347  1e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1793  threonine synthase  57.89 
 
 
339 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.684501  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2355  threonine synthase  55.88 
 
 
368 aa  346  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000649768 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2453  threonine synthase  54.55 
 
 
360 aa  346  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351882  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2622  threonine synthase  54.34 
 
 
368 aa  345  5e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  52.46 
 
 
405 aa  345  8e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0596  threonine synthase  51.51 
 
 
380 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1253  threonine synthase  60.19 
 
 
363 aa  344  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2321  threonine synthase  54.73 
 
 
369 aa  342  5e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30231  threonine synthase  55.18 
 
 
352 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09880  L-threonine synthase  55.75 
 
 
355 aa  342  5.999999999999999e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.704092  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  55.36 
 
 
360 aa  342  5.999999999999999e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  55.36 
 
 
360 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  55.36 
 
 
360 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19330  L-threonine synthase  56.81 
 
 
352 aa  340  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  57.54 
 
 
359 aa  340  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1789  threonine synthase  56.61 
 
 
356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0124  threonine synthase  52.89 
 
 
379 aa  339  4e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  57.54 
 
 
359 aa  338  7e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  57.28 
 
 
360 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0634  threonine synthase  53.53 
 
 
376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0474  threonine synthase  53.53 
 
 
376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1821  threonine synthase  50.96 
 
 
378 aa  335  9e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.540438  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1440  threonine synthase  51.28 
 
 
379 aa  334  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124795  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1395  threonine synthase  52.45 
 
 
395 aa  333  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>