More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1560 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  77.31 
 
 		 402 aa  639    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  83 
 
 		 401 aa  690    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  100 
 
 		 401 aa  816    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  78.2 
 
 		 399 aa  639    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  82.04 
 
 		 401 aa  682    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  65.5 
 
 		 405 aa  551  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  57.11 
 
 		 404 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  57.11 
 
 		 404 aa  462  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  57.25 
 
 		 403 aa  461  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  57 
 
 		 404 aa  458  1e-127  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  55.95 
 
 		 404 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  54.32 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  54.59 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  54.57 
 
 		 419 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  53.19 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  55.36 
 
 		 459 aa  382  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  53.74 
 
 		 348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  46.65 
 
 		 432 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  53.45 
 
 		 348 aa  338  7e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  47.21 
 
 		 391 aa  331  2e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  52.33 
 
 		 348 aa  328  8e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  49.72 
 
 		 354 aa  328  1.0000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  48.6 
 
 		 351 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  51.44 
 
 		 357 aa  326  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  47.3 
 
 		 394 aa  325  7e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  47.91 
 
 		 351 aa  323  3e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  48.4 
 
 		 408 aa  322  7e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  52.59 
 
 		 346 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  49.56 
 
 		 349 aa  315  7e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  51.92 
 
 		 351 aa  315  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  48 
 
 		 346 aa  315  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  51.31 
 
 		 351 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  49.71 
 
 		 362 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  48.81 
 
 		 396 aa  312  5.999999999999999e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  48.56 
 
 		 368 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  48.21 
 
 		 363 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  49.43 
 
 		 346 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  48.31 
 
 		 345 aa  310  4e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  48.01 
 
 		 356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  49.15 
 
 		 352 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  52.44 
 
 		 366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  48.98 
 
 		 406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  52.58 
 
 		 360 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  52.58 
 
 		 360 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  52.58 
 
 		 360 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  49.1 
 
 		 368 aa  305  9.000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  48.03 
 
 		 371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  47.4 
 
 		 368 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  48.85 
 
 		 403 aa  302  9e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1254  threonine synthase  47.8 
 
 		 363 aa  300  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  51.52 
 
 		 360 aa  300  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  50.44 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  48.84 
 
 		 359 aa  298  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  51.05 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  49.85 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  47.71 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  47.71 
 
 		 353 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  46.99 
 
 		 367 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  50.46 
 
 		 359 aa  295  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  47.47 
 
 		 377 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1025  threonine synthase  47.47 
 
 		 377 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  50.3 
 
 		 348 aa  295  8e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  42.79 
 
 		 414 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  49.54 
 
 		 348 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  45.4 
 
 		 352 aa  295  1e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6155  threonine synthase  49.12 
 
 		 358 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2453  threonine synthase  47.71 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351882  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  46.67 
 
 		 367 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  48.27 
 
 		 354 aa  292  6e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  48.02 
 
 		 352 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  46.67 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1022  threonine synthase  49.71 
 
 		 357 aa  291  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  47.93 
 
 		 368 aa  290  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  51.98 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  49.13 
 
 		 352 aa  290  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0596  threonine synthase  45.43 
 
 		 380 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  47.81 
 
 		 356 aa  289  5.0000000000000004e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0631  threonine synthase  50.57 
 
 		 365 aa  289  7e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  hitchhiker  0.00263749 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30231  threonine synthase  47.43 
 
 		 352 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2355  threonine synthase  46.47 
 
 		 368 aa  287  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000649768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1793  threonine synthase  50.15 
 
 		 339 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.684501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  51.03 
 
 		 377 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2963  threonine synthase  42.48 
 
 		 483 aa  286  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4032  threonine synthase  49.57 
 
 		 349 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.969378  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1808  threonine synthase  46.99 
 
 		 367 aa  286  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.71327  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  48.14 
 
 		 374 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  51.37 
 
 		 360 aa  286  5.999999999999999e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2622  threonine synthase  46.2 
 
 		 368 aa  285  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1440  threonine synthase  45.43 
 
 		 379 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5545  threonine synthase  49.28 
 
 		 351 aa  285  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.127458 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1395  threonine synthase  45.38 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  48.53 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3650  threonine synthase  49.28 
 
 		 349 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  47.03 
 
 		 370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08030  threonine synthase  47.44 
 
 		 370 aa  283  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0124  threonine synthase  46.11 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  51.07 
 
 		 331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1821  threonine synthase  45.14 
 
 		 378 aa  282  6.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.540438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1241  threonine synthase  47.38 
 
 		 344 aa  281  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000161931  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  46.47 
 
 		 354 aa  280  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>