More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0959 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  100 
 
 
331 aa  664    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  84.59 
 
 
406 aa  543  1e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  82.78 
 
 
403 aa  538  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  82.78 
 
 
347 aa  528  1e-149  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  56.39 
 
 
391 aa  357  9.999999999999999e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  54.55 
 
 
394 aa  342  4e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  52.8 
 
 
404 aa  329  3e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  54.41 
 
 
404 aa  329  4e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  55.42 
 
 
396 aa  327  3e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  54.1 
 
 
404 aa  325  5e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  52.15 
 
 
404 aa  323  2e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  51.86 
 
 
403 aa  322  4e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  52.29 
 
 
399 aa  317  1e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  52.74 
 
 
405 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  50.89 
 
 
422 aa  310  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  51.06 
 
 
401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  50.76 
 
 
419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  51.22 
 
 
402 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  50.76 
 
 
427 aa  300  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  51.07 
 
 
401 aa  299  4e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  49.54 
 
 
401 aa  298  8e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  48.94 
 
 
423 aa  295  7e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  48.99 
 
 
354 aa  292  5e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  50.29 
 
 
348 aa  292  5e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  53.31 
 
 
348 aa  291  9e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  50 
 
 
348 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  49.86 
 
 
351 aa  290  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  49.57 
 
 
356 aa  287  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  49.85 
 
 
459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  50.76 
 
 
366 aa  282  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  47.65 
 
 
368 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  50.77 
 
 
371 aa  280  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  47.65 
 
 
368 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  48.18 
 
 
408 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  48.55 
 
 
351 aa  280  3e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  49.07 
 
 
367 aa  278  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  50.31 
 
 
362 aa  278  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  48.77 
 
 
367 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  49.41 
 
 
363 aa  276  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  48.49 
 
 
349 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19071  threonine synthase  49.07 
 
 
367 aa  275  7e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.44691  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  49.69 
 
 
368 aa  273  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  53.23 
 
 
345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  46.91 
 
 
368 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2453  threonine synthase  50 
 
 
360 aa  270  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351882  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  51.51 
 
 
353 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  48.71 
 
 
346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1025  threonine synthase  48.83 
 
 
377 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  48.83 
 
 
377 aa  268  8e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1254  threonine synthase  50.46 
 
 
363 aa  268  8.999999999999999e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1821  threonine synthase  45.92 
 
 
378 aa  267  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.540438  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  49.55 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  48.42 
 
 
352 aa  266  2.9999999999999995e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  49.1 
 
 
351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  50.15 
 
 
352 aa  266  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  51.06 
 
 
377 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6155  threonine synthase  49.7 
 
 
358 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1808  threonine synthase  48.77 
 
 
367 aa  266  5e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.71327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  50.46 
 
 
352 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  50.46 
 
 
352 aa  265  7e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  50.46 
 
 
352 aa  265  7e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  51.77 
 
 
360 aa  265  7e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  50.46 
 
 
352 aa  265  8e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  50.46 
 
 
352 aa  265  8e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  49.08 
 
 
353 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  49.08 
 
 
353 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  50.16 
 
 
356 aa  265  1e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  46.97 
 
 
432 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  50.31 
 
 
359 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  48.82 
 
 
352 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  49.11 
 
 
352 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  50.31 
 
 
359 aa  263  4e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  50.15 
 
 
352 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  49.09 
 
 
352 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1745  L-threonine synthase  51.94 
 
 
365 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0188218  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  48.79 
 
 
354 aa  260  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0634  threonine synthase  45.68 
 
 
376 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0474  threonine synthase  45.68 
 
 
376 aa  261  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  46.67 
 
 
351 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  49.54 
 
 
352 aa  260  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  49.69 
 
 
360 aa  259  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  49.07 
 
 
348 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  49.38 
 
 
360 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  49.38 
 
 
360 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30231  threonine synthase  48.77 
 
 
352 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.612563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  49.38 
 
 
360 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0884  threonine synthase  50 
 
 
352 aa  258  9e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  47.41 
 
 
352 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  49.38 
 
 
346 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  48.32 
 
 
354 aa  257  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  48.77 
 
 
346 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  49.24 
 
 
348 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08030  threonine synthase  48.1 
 
 
370 aa  257  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1282  threonine synthase  51.22 
 
 
353 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1649  L-threonine synthase  47.88 
 
 
352 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1440  threonine synthase  43.63 
 
 
379 aa  255  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124795  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1793  threonine synthase  49.07 
 
 
339 aa  255  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.684501  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29950  threonine synthase  50.31 
 
 
364 aa  255  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  48.61 
 
 
361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0124  threonine synthase  46.48 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>