More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2313 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  100 
 
 
422 aa  879    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  42.51 
 
 
414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  39.85 
 
 
421 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  40.16 
 
 
416 aa  301  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  36.95 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  37.85 
 
 
402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  33.94 
 
 
404 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  34.03 
 
 
404 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  34.03 
 
 
404 aa  228  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  33.85 
 
 
403 aa  226  6e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  32.74 
 
 
404 aa  223  6e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  36.95 
 
 
402 aa  218  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  34.81 
 
 
391 aa  206  5e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33.59 
 
 
402 aa  206  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  33.77 
 
 
405 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  30.15 
 
 
408 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  33.84 
 
 
405 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  34.11 
 
 
401 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  33.68 
 
 
401 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  34.37 
 
 
401 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  32.65 
 
 
441 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  31.17 
 
 
437 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  34.18 
 
 
403 aa  190  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  31.23 
 
 
454 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  31.23 
 
 
434 aa  188  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  31.58 
 
 
403 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  30.71 
 
 
437 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  32.16 
 
 
399 aa  186  9e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  32.29 
 
 
414 aa  186  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  33.76 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  36.53 
 
 
403 aa  184  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4007  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.14 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  30.65 
 
 
441 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  31.27 
 
 
432 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  31.27 
 
 
432 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  35.86 
 
 
406 aa  180  4e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  30.05 
 
 
430 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  37.69 
 
 
331 aa  178  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  34.91 
 
 
426 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  31.27 
 
 
412 aa  176  6e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  31.79 
 
 
394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3076  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.27 
 
 
388 aa  173  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  33.17 
 
 
396 aa  172  9e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1054  threonine synthase  34.83 
 
 
377 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.470109  hitchhiker  0.00082788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1025  threonine synthase  34.83 
 
 
377 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  35.05 
 
 
348 aa  170  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  31.79 
 
 
397 aa  170  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  36.01 
 
 
347 aa  169  8e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  30.69 
 
 
424 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  31.28 
 
 
411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1254  threonine synthase  34.76 
 
 
363 aa  167  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  34.69 
 
 
353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3117  threonine synthase  34.25 
 
 
363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  31.86 
 
 
368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  31.52 
 
 
428 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2612  threonine synthase  33.05 
 
 
366 aa  164  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0979527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  34.36 
 
 
362 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2502  threonine synthase  34.73 
 
 
377 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.494999 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  31.7 
 
 
404 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  32.52 
 
 
368 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  32.52 
 
 
368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  33.53 
 
 
352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  33.53 
 
 
352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  31.7 
 
 
427 aa  163  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  31.5 
 
 
425 aa  163  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  32.2 
 
 
356 aa  163  7e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  32.39 
 
 
348 aa  162  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  35.05 
 
 
348 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  30.49 
 
 
419 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  36.01 
 
 
348 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  30.52 
 
 
425 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  33.33 
 
 
424 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  32.1 
 
 
348 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  33.93 
 
 
352 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  33.73 
 
 
352 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  33.23 
 
 
346 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  33.73 
 
 
352 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  33.13 
 
 
351 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  33.93 
 
 
352 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  33.63 
 
 
352 aa  160  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  34.35 
 
 
348 aa  160  6e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  33.63 
 
 
352 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  32.21 
 
 
396 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  32.97 
 
 
439 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  33.43 
 
 
352 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2321  threonine synthase  31.49 
 
 
369 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  32.69 
 
 
422 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0140  threonine synthase  32.32 
 
 
371 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.052405 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  30.77 
 
 
418 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  31.53 
 
 
349 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  33.04 
 
 
352 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  32.66 
 
 
353 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  31.47 
 
 
416 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  32.18 
 
 
416 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  34.4 
 
 
420 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.92 
 
 
415 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  31.65 
 
 
423 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  31.25 
 
 
421 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  31.35 
 
 
408 aa  155  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  29.79 
 
 
368 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>