More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3076 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3076  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 388 aa  756    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  35.51 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  41.04 
 
 		 414 aa  203  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  34.67 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  38.48 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  39.02 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  32.42 
 
 		 404 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  36.75 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  32.14 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  34.77 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  35.2 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  31.94 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  34.94 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  31.13 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  34.86 
 
 		 429 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  34.97 
 
 		 408 aa  170  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33.84 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  35.28 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  32.46 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  33.7 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  35.67 
 
 		 425 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  33.03 
 
 		 437 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  33.82 
 
 		 401 aa  166  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  31.21 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  33.15 
 
 		 454 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  35.53 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  33.03 
 
 		 437 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  36.15 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  34.77 
 
 		 416 aa  163  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  33.84 
 
 		 402 aa  162  7e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  32.72 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  32.72 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  33.53 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  33.23 
 
 		 401 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  33.54 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  39.88 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  32.03 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  31.88 
 
 		 412 aa  158  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  32.11 
 
 		 434 aa  156  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  35.47 
 
 		 429 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  34.63 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  35.28 
 
 		 420 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  32.72 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  33.94 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  38.81 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  34.26 
 
 		 439 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  33.03 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  32.29 
 
 		 416 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  38.04 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  34.85 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  33.23 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  33.04 
 
 		 421 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  33.33 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  35.61 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  31.3 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  35.2 
 
 		 359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  37.29 
 
 		 424 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  34.35 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  31.82 
 
 		 433 aa  145  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  34.58 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.91 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  32.11 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  33.73 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.43 
 
 		 375 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  33.85 
 
 		 396 aa  142  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.56 
 
 		 379 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1537  threonine synthase  33.88 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 545 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  30.79 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  33.24 
 
 		 375 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  33.74 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  33.13 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  33.13 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  34.66 
 
 		 360 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  33.24 
 
 		 441 aa  140  6e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.21 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  32.52 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  33.33 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  36.36 
 
 		 406 aa  136  8e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  33.74 
 
 		 459 aa  135  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1812  threonine synthase  37.69 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204555  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  32.68 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  34.55 
 
 		 347 aa  134  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  30.32 
 
 		 373 aa  133  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  32.22 
 
 		 419 aa  133  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  32.3 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  33.95 
 
 		 345 aa  132  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  33.23 
 
 		 348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1231  threonine synthase  32.39 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  33.05 
 
 		 396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4007  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.28 
 
 		 311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  33.96 
 
 		 353 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  33.23 
 
 		 348 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  32.72 
 
 		 346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3938  threonine synthase  34.53 
 
 		 352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  34.27 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  32.92 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.74 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6155  threonine synthase  34.27 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  29.05 
 
 		 351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>