More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0152 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3403  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  81.35 
 
 
381 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0152  L-threonine synthase  100 
 
 
375 aa  775    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000998245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  67.56 
 
 
375 aa  547  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1541  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  54.57 
 
 
379 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0238632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  51.98 
 
 
392 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4648  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  53.35 
 
 
376 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1568  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.58 
 
 
330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0269  threonine synthase  37.39 
 
 
360 aa  206  5e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.315454  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1400  threonine synthase  34.94 
 
 
334 aa  194  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000170642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.77 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1074  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.45 
 
 
357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0511297  normal  0.236924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.8 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00306649  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1453  threonine synthase  37.04 
 
 
361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000219249  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  33.44 
 
 
391 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4873  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.69 
 
 
359 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  33.73 
 
 
404 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  34.04 
 
 
404 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  33.73 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.58 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  32.75 
 
 
404 aa  173  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  35.38 
 
 
427 aa  172  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  31.88 
 
 
404 aa  170  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  33.59 
 
 
414 aa  169  6e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  35.96 
 
 
422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  34.22 
 
 
419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  32.84 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  34.56 
 
 
418 aa  163  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.07 
 
 
358 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  35.31 
 
 
423 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  29.34 
 
 
405 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2066  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.32 
 
 
343 aa  159  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000391247  hitchhiker  0.00289425 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  30.57 
 
 
432 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  30.57 
 
 
432 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  32.11 
 
 
425 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  30.03 
 
 
402 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  33.13 
 
 
396 aa  155  9e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3169  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.72 
 
 
386 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  32.3 
 
 
331 aa  154  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  31.8 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1472  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.56 
 
 
359 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  31.93 
 
 
413 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  29.48 
 
 
399 aa  149  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  29.56 
 
 
437 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  29.29 
 
 
419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  30.35 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  30.71 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  30.87 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  31.45 
 
 
414 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  31.37 
 
 
424 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  31.16 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  30.16 
 
 
425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  30.26 
 
 
437 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  30.45 
 
 
434 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  30.18 
 
 
441 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  30.75 
 
 
430 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  30.34 
 
 
439 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  30.81 
 
 
416 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  30 
 
 
428 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  32.25 
 
 
429 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  29.92 
 
 
401 aa  143  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  28.69 
 
 
373 aa  142  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  31.69 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  30 
 
 
454 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  30.87 
 
 
428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  30.77 
 
 
420 aa  139  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  32.99 
 
 
459 aa  139  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  31.37 
 
 
396 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  29.47 
 
 
418 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  30.29 
 
 
408 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  27.25 
 
 
404 aa  138  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  30.26 
 
 
419 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  30.79 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  30.06 
 
 
403 aa  137  4e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  30.43 
 
 
403 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  31.25 
 
 
347 aa  136  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  32.35 
 
 
432 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  29.55 
 
 
441 aa  135  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2423  threonine synthase  33.23 
 
 
354 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  27.11 
 
 
408 aa  133  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  31.2 
 
 
403 aa  132  9e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  29.29 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18541  threonine synthase  29.27 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.210401  normal  0.0322921 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  31.44 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1327  threonine synthase  28.93 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19061  threonine synthase  28.41 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_22001  threonine synthase  28.93 
 
 
368 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.821468  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  32.73 
 
 
345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  30.26 
 
 
428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  29.81 
 
 
413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2695  threonine synthase  31.5 
 
 
368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  30.82 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19251  threonine synthase  28.79 
 
 
367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.373874  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  31.38 
 
 
348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  29.23 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  31.05 
 
 
426 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  31.48 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  29.39 
 
 
351 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  31.29 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  31.38 
 
 
348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  27.78 
 
 
416 aa  127  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>