More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0305 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  78.69 
 
 
418 aa  657    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  95.79 
 
 
428 aa  810    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  100 
 
 
428 aa  857    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  74.04 
 
 
439 aa  617  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  66.43 
 
 
425 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  66.5 
 
 
425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  62.29 
 
 
428 aa  478  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  62.68 
 
 
429 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  60.88 
 
 
429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  62.77 
 
 
413 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  61.03 
 
 
416 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  61.31 
 
 
419 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  61.95 
 
 
421 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  60.09 
 
 
424 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  61.72 
 
 
418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  58.91 
 
 
416 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  59.41 
 
 
420 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  55.72 
 
 
454 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  55.22 
 
 
414 aa  422  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  54.81 
 
 
430 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  53.81 
 
 
434 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  55.26 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  52.74 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  53.87 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  54.23 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  54.23 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  55.28 
 
 
411 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  49.39 
 
 
412 aa  397  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  52.36 
 
 
408 aa  396  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  51.72 
 
 
424 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  52.41 
 
 
426 aa  338  9e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  39.9 
 
 
404 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  34.73 
 
 
404 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  34.48 
 
 
403 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  34.24 
 
 
404 aa  238  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  33.99 
 
 
404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  34.22 
 
 
405 aa  225  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  33.25 
 
 
404 aa  225  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  35.64 
 
 
401 aa  216  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  35.32 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  35.99 
 
 
414 aa  213  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  34.41 
 
 
399 aa  212  9e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33.58 
 
 
402 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  33.67 
 
 
421 aa  206  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  36.62 
 
 
441 aa  202  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  34.33 
 
 
401 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  34.15 
 
 
419 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  30.84 
 
 
416 aa  187  3e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  33.68 
 
 
396 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  34.77 
 
 
402 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  33.08 
 
 
423 aa  180  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  33.33 
 
 
422 aa  180  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  32.56 
 
 
403 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  32.47 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  33.42 
 
 
427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  32.55 
 
 
391 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  33.42 
 
 
408 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  33.84 
 
 
459 aa  170  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  32.25 
 
 
419 aa  169  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  32.56 
 
 
408 aa  169  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  38.74 
 
 
346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.34 
 
 
415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  36.83 
 
 
397 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  30.89 
 
 
413 aa  162  8.000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  36.75 
 
 
346 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  29.31 
 
 
403 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3895  threonine synthase  39.12 
 
 
360 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.997938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3969  threonine synthase  39.12 
 
 
360 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal  0.774018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3881  threonine synthase  39.12 
 
 
360 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.92 
 
 
375 aa  160  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  41.12 
 
 
355 aa  159  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4347  threonine synthase  37.06 
 
 
359 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583666  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  33.63 
 
 
353 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  33.63 
 
 
353 aa  157  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  35.03 
 
 
348 aa  156  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2299  threonine synthase  36.49 
 
 
359 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  35.21 
 
 
354 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  34.43 
 
 
352 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  34.43 
 
 
352 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  34.76 
 
 
404 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4007  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.92 
 
 
311 aa  155  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569923  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  34.43 
 
 
352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  36.47 
 
 
360 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3724  threonine synthase  37.86 
 
 
377 aa  153  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0780152  normal  0.697204 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  34.43 
 
 
352 aa  153  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  34.43 
 
 
352 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.11 
 
 
392 aa  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4338  threonine synthase  35.59 
 
 
362 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  34.13 
 
 
352 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  34.13 
 
 
352 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  30.68 
 
 
432 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  31.68 
 
 
545 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  34.73 
 
 
352 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  34.27 
 
 
348 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1006  threonine synthase  37.67 
 
 
374 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  34.46 
 
 
348 aa  150  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  33.83 
 
 
352 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  34.43 
 
 
352 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  34.13 
 
 
352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  33.04 
 
 
351 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>