More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1205 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  79.81 
 
 		 420 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  100 
 
 		 421 aa  848    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  74.18 
 
 		 413 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  71.63 
 
 		 429 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  71.74 
 
 		 418 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  66.75 
 
 		 429 aa  552  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  68.94 
 
 		 424 aa  547  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  65.53 
 
 		 416 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  64.29 
 
 		 428 aa  525  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  64.37 
 
 		 416 aa  518  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  62.14 
 
 		 419 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  65 
 
 		 425 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  64.03 
 
 		 425 aa  500  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  60.48 
 
 		 418 aa  493  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  61.95 
 
 		 428 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  60.15 
 
 		 439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  62.2 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  52.71 
 
 		 454 aa  441  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  52.76 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  54.84 
 
 		 414 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  52.96 
 
 		 434 aa  436  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  53.38 
 
 		 437 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  53.45 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  50.59 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  51.32 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  50.59 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  52.06 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  57.33 
 
 		 411 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  52.58 
 
 		 408 aa  404  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  54.21 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  53.42 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  43.68 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  39.22 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  38.96 
 
 		 404 aa  272  7e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  38.18 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  38.48 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  35.17 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  35.47 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  35.4 
 
 		 421 aa  247  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  36.05 
 
 		 401 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  34.9 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  36.12 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33.68 
 
 		 402 aa  225  9e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  34.89 
 
 		 414 aa  219  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  35.12 
 
 		 401 aa  219  8.999999999999998e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  33.86 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  35.17 
 
 		 419 aa  206  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  35.82 
 
 		 427 aa  203  5e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  37.44 
 
 		 422 aa  202  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  35.58 
 
 		 423 aa  199  6e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  34.81 
 
 		 441 aa  196  8.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  32.02 
 
 		 408 aa  196  9e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  35.28 
 
 		 419 aa  196  9e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  35.92 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  34.44 
 
 		 402 aa  189  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  33.68 
 
 		 403 aa  189  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  32.04 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.62 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  37.12 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  34.23 
 
 		 459 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  36.81 
 
 		 346 aa  180  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  31.22 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  34.95 
 
 		 354 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  32.09 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  37.24 
 
 		 370 aa  176  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  36.5 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  35.61 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  36.2 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  36.2 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  33.15 
 
 		 353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  36.2 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  33.15 
 
 		 353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  36.5 
 
 		 352 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  35.91 
 
 		 352 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  35.91 
 
 		 352 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1834  threonine synthase  36.28 
 
 		 352 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  35.91 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3356  threonine synthase  35.91 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000444618  hitchhiker  0.0000000000000127983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  33.78 
 
 		 545 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  34.82 
 
 		 397 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  31.89 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  30.33 
 
 		 402 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3123  L-threonine synthase  38.04 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  33.23 
 
 		 346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  32.31 
 
 		 351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  32.04 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  31.51 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  32.68 
 
 		 357 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  29.79 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.38 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  32.04 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1200  threonine synthase  35.54 
 
 		 351 aa  161  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  33.43 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  32.04 
 
 		 354 aa  160  4e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  32.42 
 
 		 351 aa  160  6e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  33.63 
 
 		 348 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  34.08 
 
 		 345 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  35.67 
 
 		 360 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  32.77 
 
 		 348 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4152  threonine synthase  35.84 
 
 		 361 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.231513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>