More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2573 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  100 
 
 
405 aa  830    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  66.17 
 
 
403 aa  554  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  67.74 
 
 
403 aa  552  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  49.75 
 
 
413 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  47.52 
 
 
408 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  49.48 
 
 
404 aa  328  7e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  44.44 
 
 
396 aa  305  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  38.2 
 
 
404 aa  269  7e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  38.46 
 
 
404 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  38.26 
 
 
404 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  36.68 
 
 
404 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  37.67 
 
 
403 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  38.68 
 
 
441 aa  257  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  37.82 
 
 
414 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.71 
 
 
415 aa  232  9e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  36.05 
 
 
416 aa  229  8e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  37.44 
 
 
401 aa  227  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  36.62 
 
 
401 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  36.29 
 
 
405 aa  223  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  34.48 
 
 
430 aa  222  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  36.67 
 
 
402 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  36.84 
 
 
401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  36.57 
 
 
399 aa  219  7e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  34.26 
 
 
414 aa  218  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  34.37 
 
 
437 aa  215  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  34.28 
 
 
434 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  33.85 
 
 
454 aa  213  7e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  33.76 
 
 
421 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  33.08 
 
 
432 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  33.08 
 
 
432 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  34.85 
 
 
437 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  33.17 
 
 
441 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  33.68 
 
 
419 aa  202  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  33.84 
 
 
422 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  39.22 
 
 
423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  37.05 
 
 
419 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  31.33 
 
 
404 aa  193  6e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  36.27 
 
 
397 aa  192  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  35.82 
 
 
427 aa  192  8e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  33.25 
 
 
425 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  32.19 
 
 
425 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  32.82 
 
 
408 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  31.08 
 
 
412 aa  190  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  33.67 
 
 
439 aa  188  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  35.58 
 
 
422 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  33.76 
 
 
428 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  34.34 
 
 
429 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  33.16 
 
 
424 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  32.47 
 
 
428 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  37.72 
 
 
459 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  32.32 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  32.03 
 
 
391 aa  173  5e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  33.33 
 
 
402 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  30.85 
 
 
418 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  33.25 
 
 
413 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  33.17 
 
 
418 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  32.9 
 
 
411 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  32.06 
 
 
416 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1259  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.14 
 
 
356 aa  166  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.28 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  35.81 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  31.12 
 
 
419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  35.81 
 
 
406 aa  164  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  33.33 
 
 
424 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  31.59 
 
 
429 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  35.65 
 
 
331 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  31.96 
 
 
428 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  30.36 
 
 
416 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  32.07 
 
 
426 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  32.04 
 
 
421 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  31.12 
 
 
433 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  38.62 
 
 
347 aa  159  7e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  31.88 
 
 
432 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4420  threonine synthase  33.16 
 
 
420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.698202  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1424  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.81 
 
 
371 aa  152  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  33.24 
 
 
420 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  32.9 
 
 
396 aa  152  1e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  34.34 
 
 
356 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  32.38 
 
 
394 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  31.96 
 
 
354 aa  149  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0942  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.06 
 
 
408 aa  149  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0898  threonine synthase  33.43 
 
 
354 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  34.51 
 
 
348 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0841  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.95 
 
 
358 aa  146  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1902  threonine synthase  34.76 
 
 
360 aa  145  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0324  threonine synthase  35.07 
 
 
352 aa  145  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1783  threonine synthase  35.33 
 
 
352 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1971  threonine synthase  35.63 
 
 
352 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0621925  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  34.22 
 
 
348 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2052  threonine synthase  35.33 
 
 
352 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.412659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1826  threonine synthase  35.33 
 
 
352 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00172769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1800  threonine synthase  35.33 
 
 
352 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0158602  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2003  threonine synthase  35.33 
 
 
352 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1677499999999998e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1969  threonine synthase  35.33 
 
 
352 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0589292  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1497  threonine synthase  35.33 
 
 
352 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0143366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2074  threonine synthase  35.33 
 
 
352 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2895  threonine synthase  32.56 
 
 
353 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0411595  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0634  threonine synthase  29.47 
 
 
373 aa  144  4e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  32.74 
 
 
353 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  32.74 
 
 
353 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>