More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8125 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8125  threonine synthase  100 
 
 		 416 aa  843    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8913  threonine synthase  78.19 
 
 		 429 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3301  threonine synthase  73.22 
 
 		 416 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4205  threonine synthase  75.68 
 
 		 419 aa  600  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0226  threonine synthase  73.28 
 
 		 428 aa  594  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00204535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3987  threonine synthase  68.23 
 
 		 424 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0874528  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1550  threonine synthase  65.38 
 
 		 429 aa  535  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.126151  normal  0.344692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0801  threonine synthase  66.75 
 
 		 413 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0100  threonine synthase  64.99 
 
 		 418 aa  523  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1205  threonine synthase  64.37 
 
 		 421 aa  518  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12610  threonine synthase  63.17 
 
 		 420 aa  496  1e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.908035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4397  threonine synthase  61.15 
 
 		 425 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0176  threonine synthase  61.23 
 
 		 425 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0445  threonine synthase  59.31 
 
 		 418 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.434076 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0305  threonine synthase  58.91 
 
 		 428 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0781  threonine synthase  58.56 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.994747  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0263  threonine synthase  60.2 
 
 		 428 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4952  threonine synthase  55.17 
 
 		 454 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.403318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5014  threonine synthase  55.37 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1848  threonine synthase  55.04 
 
 		 414 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4066  threonine synthase  52.82 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0219584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4028  threonine synthase  52.82 
 
 		 432 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1782  threonine synthase  53.33 
 
 		 430 aa  428  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4348  threonine synthase  53.58 
 
 		 437 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0192799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3191  threonine synthase  54.32 
 
 		 411 aa  426  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0891215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2960  threonine synthase  52.71 
 
 		 434 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0549181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0595  threonine synthase  52.48 
 
 		 437 aa  418  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0626  threonine synthase  50.86 
 
 		 412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.650783  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0806  threonine synthase  51.23 
 
 		 408 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3605  threonine synthase  50.51 
 
 		 424 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0593763  normal  0.0360508 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1549  threonine synthase  45.69 
 
 		 404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.738086 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3579  threonine synthase  50.13 
 
 		 426 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1541  threonine synthase  37.6 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1134  threonine synthase  37.6 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0817  threonine synthase  37.08 
 
 		 404 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2049  threonine synthase  36.25 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1140  threonine synthase  37.34 
 
 		 404 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1998  L-threonine synthase  35.28 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0346  threonine synthase  34.7 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.159817  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1728  threonine synthase  33.9 
 
 		 421 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1560  threonine synthase  34.48 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.77266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0713  threonine synthase  34.24 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0941717  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1420  threonine synthase  34.15 
 
 		 399 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.673193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0683  threonine synthase  33.25 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.761513 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1619  threonine synthase  33 
 
 		 402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.944932 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1229  threonine synthase  32.68 
 
 		 416 aa  213  5.999999999999999e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1755  threonine synthase  34.94 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4034  threonine synthase  33.85 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.338986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1068  threonine synthase  33.94 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1480  L-threonine synthase  32.49 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0319  threonine synthase  33.76 
 
 		 419 aa  192  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2391  threonine synthase  35.99 
 
 		 402 aa  192  8e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.986768 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2719  threonine synthase  33.08 
 
 		 427 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.767894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0782  threonine synthase  34.52 
 
 		 459 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.913789  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3949  threonine synthase  34.97 
 
 		 419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0977637  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1493  threonine synthase  33.67 
 
 		 423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.221995  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3080  threonine synthase  36.67 
 
 		 346 aa  182  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615422  hitchhiker  0.00256944 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1771  threonine synthase  31.78 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2927  threonine synthase  34.2 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1324  threonine synthase  30.77 
 
 		 402 aa  177  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3186  threonine synthase  35.15 
 
 		 346 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000625844  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0592  threonine synthase  33.99 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0830  threonine synthase  33.33 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0107  threonine synthase  29.92 
 
 		 403 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0274  threonine synthase  33.33 
 
 		 403 aa  173  5.999999999999999e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1039  threonine synthase  31.38 
 
 		 408 aa  172  7.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.602173  normal  0.287119 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2573  threonine synthase  30.36 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0058  threonine synthase  35.17 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1367  threonine synthase  33.15 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2313  L-threonine synthase  31.47 
 
 		 422 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1698  threonine synthase  31.85 
 
 		 394 aa  166  5e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.80409  normal  0.346904 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1863  threonine synthase  32.9 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0615  threonine synthase  27.95 
 
 		 403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0959  threonine synthase  34.42 
 
 		 331 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0152595 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1306  threonine synthase  36.12 
 
 		 348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.331219 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1839  threonine synthase  33.16 
 
 		 406 aa  162  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_988  threonine synthase  34.45 
 
 		 348 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1015  threonine synthase  33.99 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1218  response regulator receiver protein  33.86 
 
 		 545 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1205  threonine synthase  34.17 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2310  threonine synthase  35.19 
 
 		 351 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1608  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.02 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.210158 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0391  threonine synthase  33.43 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0909  L-threonine synthase  33.04 
 
 		 349 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000973951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0374  threonine synthase  34.03 
 
 		 348 aa  159  9e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3040  threonine synthase  35.54 
 
 		 353 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0378  threonine synthase  35.21 
 
 		 356 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3128  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  31.23 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.258773  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1152  threonine synthase  31.75 
 
 		 354 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2252  threonine synthase  36.69 
 
 		 345 aa  157  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0353523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4458  threonine synthase  29.47 
 
 		 413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0649612  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4507  threonine synthase  33.33 
 
 		 357 aa  156  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.871265  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08030  threonine synthase  33.63 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000508006  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0375  threonine synthase  35.12 
 
 		 347 aa  154  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11322  threonine synthase  35.01 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4372  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.66 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2096  threonine synthase  36.58 
 
 		 370 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000119841  normal  0.0436227 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0119  threonine synthase  27.94 
 
 		 432 aa  153  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1417  threonine synthase  33.53 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1390  threonine synthase  33.53 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00428061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>